针对您提出的问题，即“做手术申请了一个月假后来医生又开了一个月假条单位不批怎么处理”，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们要明确的是，劳动者在患病或受伤时，享有就医治疗及休息休假的权利，这是受法律保护的。用人单位在管理病休假时，虽然可以制定相应的规章制度，但这些制度必须合法、合理，并且不能侵犯劳动者的合法权益。
针对您的情况，您已经因为手术申请了一个月的病假，并且后来医生又根据您的病情开具了第二个月的病假条。这表明您的病情确实需要更长时间的休息和治疗。在这种情况下，单位无正当理由不得拒绝您的病假申请。
如果单位不批准您的第二个月病假申请，您可以采取以下措施：
与单位沟通：
- 首先，您可以尝试与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，解释您的病情和医生的建议，说明您确实需要继续休息和治疗。
- 提供医生开具的病假条和相关医疗证明，以支持您的申请。
了解单位规章制度：
- 查阅单位的员工手册或相关规章制度，了解关于病假申请和批准的具体规定。
- 如果单位的规章制度中存在不合理或违法的条款，如“必须到指定医院复查”或“病假不予批准，已休天数按旷工处理”等，您可以向单位指出这些条款的问题，并要求单位按照法律规定处理您的病假申请。
寻求法律援助：
- 如果单位仍然拒绝批准您的病假申请，并且您认为单位的做法侵犯了您的合法权益，您可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 劳动监察部门或法律援助机构会对您的情况进行调查和评估，并根据相关法律法规给出相应的建议或处理意见。
考虑劳动仲裁或诉讼：
- 如果问题无法通过沟通或投诉解决，您还可以考虑向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
- 在仲裁或诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明您的病情和医生的建议，以及单位拒绝批准病假申请的违法行为。
最后，我要强调的是，健康权是劳动者重要的基本权利，用人单位应当予以保障。在您患病或受伤需要休息和治疗时，单位应该给予理解和支持，而不是设置障碍或拒绝批准病假申请。希望您能够顺利解决问题，早日康复。