公司以经营成本在抵税后又在员工业绩中扣除这笔费用，这一做法通常是不合法的。以下从几个角度进行详细分析：

1. 税收与成本扣除的合法性基础：

   • 公司在经营过程中，确实有权根据税法规定进行成本扣除和税收抵免，这是合法的税务筹划行为。然而，这种扣除和抵免应当基于真实的交易和合理的成本支出，且必须符合税法的相关规定。
   • 如果公司试图通过虚构成本或不合理地分配成本来减少税负，这可能构成偷税漏税行为，是违法的。

2. 员工业绩与成本扣除的关系：

   • 员工的业绩通常与他们的薪酬、奖金或提成等直接相关，是员工劳动成果的体现。公司应当根据员工的业绩和合同约定来支付相应的报酬。
   • 将经营成本（尤其是已经用于抵税的成本）再从员工业绩中扣除，实际上是在变相减少员工的劳动报酬。这种做法缺乏合理的商业逻辑和法律依据，可能损害员工的合法权益。

3. 劳动合同与法律法规的约束：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司应当按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 如果公司未经员工同意，擅自将经营成本从员工业绩中扣除，这可能构成未及时足额支付劳动报酬的行为，员工有权要求公司支付拖欠的工资，并可能依据法律规定要求公司支付赔偿金。

4. 可能的法律后果：

   • 如果公司坚持这种不合法的做法，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司纠正违法行为并支付拖欠的工资。
   • 在极端情况下，如果公司的行为构成犯罪（如偷税漏税等），还可能面临刑事责任的追究。

建议：

• 对于公司而言，应当遵守税法和劳动法的相关规定，合理进行税务筹划和成本扣除，确保员工的合法权益不受损害。
• 对于员工而言，如果发现公司存在这种不合法的做法，应当及时与公司沟通协商，要求公司纠正。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

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