公司业绩不能作为扣除个人绩效的合法依据。下面我将从法律角度详细解释这一结论。

法律背景

在劳动关系中，员工的绩效通常是根据其个人工作表现、工作成果以及公司设定的绩效考核标准来评定的。而公司业绩，即公司整体的经营成果或财务状况，是反映公司整体运营情况的一个指标，它并不直接等同于或决定员工的个人绩效。

法律分析

1. 绩效考核的合法性：公司设定绩效考核制度，应当遵循公平、公正、合理的原则，并且需要与员工进行充分的沟通和协商。绩效考核制度应当明确、具体，能够客观反映员工的工作表现和成果。

2. 公司业绩与个人绩效的关系：公司业绩是公司整体运营情况的反映，它可能受到市场环境、公司战略、管理团队等多种因素的影响。而个人绩效则是员工个人工作表现和成果的体现。将公司业绩直接与个人绩效挂钩，并作为扣除个人绩效的依据，显然违背了绩效考核的公平性和合理性原则。

3. 法律后果：如果公司擅自将公司业绩作为扣除个人绩效的依据，可能会侵犯员工的合法权益，如工资、奖金等。员工有权向公司提出异议，要求公司纠正错误行为，并赔偿因此造成的损失。在极端情况下，员工还可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

法律建议

1. 完善绩效考核制度：公司应当制定完善、合理的绩效考核制度，明确绩效考核的标准、方法和程序，确保绩效考核的公平性和公正性。

2. 加强沟通与协商：在制定绩效考核制度时，公司应当与员工进行充分的沟通和协商，听取员工的意见和建议，确保绩效考核制度能够得到员工的认可和支持。

3. 遵守法律法规：公司在执行绩效考核制度时，应当严格遵守相关法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。如果公司需要调整绩效考核制度或扣除员工绩效，应当事先与员工进行协商，并依法履行相关程序。

综上所述，公司业绩不能作为扣除个人绩效的合法依据。公司应当制定合理、公平的绩效考核制度，并严格遵守相关法律法规的规定，确保员工的合法权益得到保障。如果你在这方面遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。