非法扣留公积金的赔偿问题，需根据具体情况确定赔偿方式和金额，一般包括要求单位补缴公积金、支付经济补偿金，甚至可能涉及行政处罚和民事赔偿。具体分析如下：

1. 补缴公积金及利息
   根据《住房公积金管理条例》第三十八条，单位逾期不缴或少缴住房公积金的，住房公积金管理中心有权责令限期缴存；逾期仍不缴存的，可申请法院强制执行。因此，首要赔偿方式是要求单位补缴被扣留的公积金，并支付同期银行存款利息。利息计算通常以公积金账户实际应缴金额为基数，按同期存款利率计算。

2. 经济补偿金（若涉及劳动争议）
   若单位非法扣留公积金导致劳动者解除劳动合同，根据《劳动合同法》第三十八条和第四十六条，劳动者有权要求单位支付经济补偿金。补偿标准为：按劳动者在本单位工作年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的按一年计算；不满六个月的支付半个月工资。月工资指劳动合同解除前十二个月的平均工资，且不得超过当地职工月平均工资三倍。

3. 行政处罚与民事赔偿的叠加
   除补缴和补偿外，单位还可能面临行政处罚。根据《住房公积金管理条例》第三十七条，单位不办理住房公积金缴存登记或不为本单位职工办理账户设立手续的，可处1万元以上5万元以下罚款。若单位行为给劳动者造成其他损失（如因公积金缺失导致贷款额度降低等），劳动者可另行主张民事赔偿，但需举证损失与单位行为的直接因果关系。

行动建议：

• 第一步：向单位提出书面补缴要求，并保留送达证据（如邮件、签收单）；
  
• 第二步：若单位拒绝，向当地住房公积金管理中心投诉，提交劳动合同、工资流水等证明材料；
  
• 第三步：若涉及劳动争议（如被迫离职），可同步申请劳动仲裁，主张经济补偿金；
  
• 第四步：若损失较大或程序复杂，建议委托律师介入，通过法律程序最大化权益。
  

注意事项：公积金纠纷具有时效性，劳动者需在知道或应当知道权利被侵害之日起1年内主张权利（劳动仲裁时效）或3年内主张行政投诉（部分地区规定）。具体操作需结合当地政策，如有疑问可直接向我咨询。