结论：船厂内部开罚款单是否违法不能一概而论，需分情况讨论。具体分析如下：

1. 若罚款依据合法且程序合规，一般不违法
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位可依法制定规章制度，若船厂通过民主程序（如职工代表大会讨论）制定了包含罚款条款的规章制度，且内容不违反法律强制性规定（如罚款金额不超过月工资20%）、已向劳动者公示，则罚款行为具有合法性。例如，员工因严重违反操作规程导致设备损坏，船厂依据制度扣减部分工资作为赔偿，属于合法管理行为。

2. 若罚款依据或程序存在瑕疵，则可能违法

   • 依据违法：若船厂规章制度未经过民主程序制定，或罚款条款违反《工资支付暂行规定》中“不得克扣工资”的强制性规定（如以“迟到罚款”为由随意扣减工资），则罚款行为无效。
     
   • 程序违法：即使制度合法，若罚款前未告知员工具体违规事实、未听取员工申辩，或未出具书面罚款决定，也可能因程序瑕疵被认定为违法。
     
   • 金额超限：根据《企业职工奖惩条例》（虽已废止，但部分原则仍适用），罚款金额一般不得超过员工月工资的20%，超出部分无效。

3. 特殊情形：罚款可能被认定为“变相克扣工资”
   若船厂以罚款为名行克扣工资之实（如将罚款与绩效挂钩但无合理依据，或罚款后未提供劳动改善机会），可能被劳动监察部门认定为违法行为，员工可依据《劳动争议调解仲裁法》申请仲裁，要求返还罚款并赔偿损失。

建议：

• 若您是船厂员工，可要求船厂出示罚款依据的规章制度，核对制定程序、公示情况及罚款金额是否合法；
  
• 若您是船厂管理者，建议完善制度制定流程，确保罚款依据合法、程序合规，并保留员工签字确认的公示记录；
  
• 双方均可通过劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁解决争议。
  

如有进一步细节（如罚款原因、金额、制度内容等），可向我补充说明，我会为您具体分析。