当政府项目的结算金额超过合同金额的10%时，这确实是一个需要谨慎处理的问题，因为它涉及到合同履行、资金管理和双方权益的保障。以下是我为您提供的详细处理步骤和建议：
一、核查合同条款
首先，您需要仔细审查合同中的相关条款，特别是关于价格调整、变更程序和结算方式的部分。
价格调整条款：查看合同中是否规定了因原材料价格波动、政策法规变化等不可抗力因素导致的价格调整机制。如果结算金额的超出是由于这些因素造成的，并且符合合同中的调整条件，那么应按照合同规定的程序进行操作。
变更程序条款：确认合同中是否明确了变更的流程和要求。如果结算金额的超出是由于合同履行过程中的变更事项（如工程变更、服务内容增加）导致的，那么需要检查这些变更是否遵循了合同中约定的变更审批程序。未经适当审批的变更可能无法得到认可，从而影响超出部分的结算。
二、核实超出原因
在核查合同条款的基础上，您需要进一步核实结算金额超出的具体原因，并收集相关证据。
工程量或服务量增加：如果是因为工程量或服务范围的增加导致结算金额超出，那么需要核对相关的变更指令、验收记录等文件，以证明增加的部分是合理且必要的。新增部分应按照合同单价或合理市场价格计算费用。
价格因素：分析原材料价格、人工成本等市场波动对成本的影响。如果合同中有关于价格风险分担的约定，那么应依约处理。同时，考虑政策法规变化（如税率调整）对结算金额的影响，并收集相关证据支持调整申请。
其他因素：调查是否存在质量问题、工期延误等情况导致的额外费用。根据合同约定和实际情况确定责任方及费用承担方式。
三、友好协商与补充协议
在明确超出原因和收集相关证据后，您应主动与合同相对方（如政府部门或承包商）进行友好协商。
坦诚交流：以书面形式详细说明超出原因、依据及计算方式，并提出合理的结算要求。在交流过程中，保持坦诚和开放的态度，寻求共识和解决方案。
签订补充协议：如果双方达成一致意见，可以签订补充协议来明确超出部分金额的结算方式、支付时间等具体条款。补充协议应与原合同具有同等法律效力，并作为后续结算和支付的依据。
四、寻求第三方机构介入
如果协商过程中存在较大争议或无法达成一致意见，您可以考虑寻求第三方机构的介入。
调解：向行业协会、商会或专业调解机构申请调解。这些机构具有中立地位和专业知识，可以帮助双方解决问题并达成和解。
鉴定或评估：对于专业性较强的问题（如工程造价评估），可以共同委托有资质的专业鉴定机构或评估机构进行鉴定或评估。鉴定或评估报告可以作为双方协商或后续法律程序的重要参考依据。
五、法律途径
如果协商、调解和第三方鉴定均无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来解决争议。
发送律师函：委托律师向对方发送律师函，明确立场和要求，并给予合理期限要求对方回应。律师函可以起到警示和催促的作用，有时能够促使对方重新考虑并达成和解。
仲裁或诉讼：如果律师函未能达到预期效果，您可以根据合同中的争议解决条款选择仲裁或向法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，应充分准备证据材料，并按照法定程序进行举证、质证等环节，以维护自身合法权益。
六、持续沟通与合作
在整个处理过程中，保持与对方的良好沟通至关重要。尝试理解对方立场和需求，寻求双赢的解决方案。同时，也要考虑长期合作关系的维护，避免因为一次争议而破坏了未来的合作机会。
综上所述，处理政府项目结算金额超过合同金额10%的问题需要综合考虑多种因素，并根据具体情况采取合适的措施。通过遵循上述步骤和建议，您可以更有效地解决争议并保护双方的合法权益。