村书记在承包本村集体土地时暗箱操作，属于违法行为。具体分析如下：

1. 违反法定程序
   根据《农村土地承包法》及《村民委员会组织法》，村集体土地承包需遵循“民主议定程序”，包括召开村民会议或村民代表会议、公开竞标、公示承包方案等环节。若村书记未履行上述程序，擅自决定承包对象或条件（如低价承包、指定亲属承包），即构成程序违法。

2. 损害集体利益
   村集体土地属于全体村民共有，承包收入应归集体所有。暗箱操作可能导致土地被低价承包，损害村民经济利益。例如，若承包价格明显低于市场价，或承包期限过长，均可能涉嫌“以权谋私”，需承担民事赔偿责任。

3. 可能涉及刑事犯罪
   若村书记通过伪造文件、虚报面积、隐瞒收益等手段侵占集体资产，可能触犯《刑法》中的“职务侵占罪”或“贪污罪”（若其属于国家工作人员）。例如，将承包款据为己有，或与承包人串通分赃，均可能面临刑事追责。

4. 村民救济途径

   • 行政投诉：向乡镇政府或县级农业农村部门举报，要求调查程序合法性。
     
   • 民事诉讼：村民可联名起诉，请求确认承包合同无效，并要求返还土地或赔偿损失。
     
   • 刑事报案：若发现犯罪线索，可直接向公安机关报案。

建议：若您掌握相关证据（如会议记录、承包合同、转账记录等），可进一步向我描述细节，我将协助分析具体法律风险及维权策略。