镇里代理村书记侵占集体土地是违法的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律性质与责任
法律性质：
- 代理村书记侵占集体土地，属于侵占、挪用集体土地资源的行为。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，集体土地属于农民集体所有，任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地。
法律责任：
- 行政责任：如果侵占行为尚不构成犯罪，根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，将依法给予处分，如警告、罚款、没收违法所得等。
- 刑事责任：若代理村书记为国家工作人员，其利用职务上的便利侵占集体土地，可能构成贪污罪，根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条的规定，将依法追究刑事责任。对于非国家工作人员，若利用职务上的便利侵占集体土地，可能构成职务侵占罪，根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，同样将依法追究刑事责任。
二、采取法律措施
向相关部门反映：
- 村民可以向当地乡镇人民政府或县级土地管理部门反映情况，要求调查处理。这些部门有责任对侵占集体土地的行为进行调查，并根据调查结果采取相应的法律措施。
提起民事诉讼：
- 如果代理村书记的侵占行为导致村民经济损失，村民可以向人民法院提起民事诉讼，要求代理村书记承担民事责任，包括返还土地、赔偿损失等。
提起刑事诉讼：
- 若代理村书记的侵占行为构成犯罪，村民可以向公安机关报案，要求追究其刑事责任。公安机关将依法进行调查处理，若构成犯罪，将依法提起公诉。
三、注意事项
保留证据：
- 村民在采取法律措施前，应尽可能收集并保留相关证据，如土地权属证明、侵占行为的照片或视频、证人证言等。这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用，有助于证明代理村书记的侵占行为。
了解法律程序：
- 村民在采取法律措施时，应了解相关的法律程序和要求，如如何向相关部门反映情况、如何提起民事诉讼或刑事诉讼等。这有助于村民更有效地维护自己的合法权益。
四、可能面临的法律后果
- 如果代理村书记的侵占行为被查实，其可能面临行政处罚、刑事处罚以及民事赔偿等法律后果。同时，其侵占的土地也将被依法收回，并恢复原状。
总结与建议：镇里代理村书记侵占集体土地是违法的，村民应积极采取法律措施维护自己的合法权益。在采取法律措施前，村民应了解相关法律法规和程序要求，并尽可能收集保留相关证据。如果村民在维护自己权益的过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律建议和帮助。