入职一个公司，但工资由其他分公司发放，这一做法在法律上并不必然违法，但需满足一定条件并遵循相关法律规定。以下从不同角度进行分析：

一、合法性分析

1. 内部财务安排：

   • 如果公司与其分公司之间存在合法的内部财务安排，且这种安排不违反法律法规的强制性规定，那么工资由其他分公司发放是合法的。例如，总公司与分公司之间可能存在资金调配、税务筹划等内部财务安排，导致工资由某一分公司统一发放。

2. 劳动合同约定：

   • 关键在于劳动合同中的约定。如果劳动合同中明确约定了工资由其他分公司发放，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法是合法的。劳动合同是双方自愿达成的协议，只要内容合法，就具有法律效力。

3. 实际用工关系：

   • 实际用工关系也是判断合法性的重要因素。如果员工实际上是在入职的公司工作，且该公司对其进行了管理、指挥和监督，那么即使工资由其他分公司发放，也不影响实际用工关系的成立。在这种情况下，员工与入职公司之间存在劳动关系，而工资发放方式只是劳动关系中的一个细节问题。

二、潜在风险与注意事项

1. 税务与社保问题：

   • 工资由其他分公司发放可能涉及税务和社保的缴纳问题。需要确保工资发放方按照法律规定为员工缴纳个人所得税和社会保险费，避免出现漏缴、少缴等问题。

2. 劳动争议处理：

   • 在发生劳动争议时，如果工资由其他分公司发放，可能会增加争议处理的复杂性。例如，在确定劳动关系主体、计算经济补偿金等方面可能会遇到困难。因此，建议在劳动合同中明确约定相关事项，以减少潜在争议。

3. 公司财务与经营状况：

   • 需要关注工资发放方的财务和经营状况。如果工资发放方出现财务问题或经营困难，可能会影响员工的工资支付。因此，员工在选择入职时，应对公司的整体财务和经营状况进行了解。

三、法律建议

1. 明确劳动合同条款：

   • 在签订劳动合同时，应明确约定工资发放方、发放方式、发放时间等关键条款。这有助于保护员工的合法权益，减少潜在争议。

2. 保留相关证据：

   • 员工应保留与工资发放相关的证据，如工资条、银行转账记录等。这些证据在发生劳动争议时具有重要的证明作用。

3. 及时咨询与维权：

   • 如果员工对工资发放方式存在疑问或担忧，应及时向公司咨询并了解相关情况。如果发现公司存在违法行为或侵害员工权益的行为，应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

总结来说，入职一个公司但工资由其他分公司发放并不必然违法，但需满足一定条件并遵循相关法律规定。员工在入职前应仔细阅读劳动合同条款，了解工资发放方式及相关风险，并在必要时咨询专业律师以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。