结论：一二三调都是建设用地的老厂房翻建，是否会被认定为新增非法占地，需结合具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 土地性质与规划：

   • 若老厂房所在土地在一二三调中均被确认为建设用地，且该土地的使用符合当地的土地利用总体规划和城乡规划，那么翻建行为通常不会被认定为新增非法占地。因为建设用地的用途本身就包括建设、翻建等行为，只要翻建行为符合规划要求和相关法律法规，就是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，建设用地是指建造建筑物、构筑物的土地，包括城乡住宅和公共设施用地、工矿用地、交通水利设施用地、旅游用地、军事设施用地等。翻建行为若未改变土地用途，且符合规划，则不属于非法占地。

2. 翻建行为的合法性：

   • 翻建行为需要取得相应的建设许可，如建设工程规划许可证等。若未取得相关许可，即使土地性质为建设用地，翻建行为也可能因违反建设管理法规而被认定为违法建设，但这并不等同于新增非法占地。非法占地通常指的是未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的行为。
   • 建议：在进行翻建前，应咨询当地规划部门或建设管理部门，了解翻建所需的手续和条件，确保翻建行为的合法性。

3. 历史遗留问题与政策变化：

   • 若老厂房存在历史遗留问题，如土地权属不清、规划变更等，翻建行为可能受到这些因素的影响。此外，政策的变化也可能对翻建行为的合法性产生影响。例如，若当地政策对老旧厂房的翻建有特殊规定或限制，需遵守这些规定。
   • 案例参考：在实际操作中，因历史遗留问题或政策变化导致的翻建纠纷并不少见。因此，在进行翻建前，应充分了解当地的历史情况和政策变化，避免因此产生不必要的法律风险。

4. 非法占地的认定标准：

   • 非法占地的认定通常基于未经批准或骗取批准非法占用土地的行为。若翻建行为是在合法取得土地使用权且符合规划的前提下进行的，则不会被认定为非法占地。
   • 法律后果：若被认定为非法占地，可能面临责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状以及罚款等法律后果。

综合建议：

• 在进行老厂房翻建前，应首先确认土地性质、规划用途以及是否需要取得相关建设许可。
• 咨询当地规划部门或建设管理部门，了解翻建所需的手续和条件，确保翻建行为的合法性。
• 关注当地政策变化，避免因政策调整导致翻建行为违法。
• 若存在历史遗留问题或权属不清等情况，应提前进行解决或咨询专业律师以获取法律建议。

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