结论前置：员工请病假一年，医疗期满后双方协商解除劳动合同，单位支付经济补偿金的标准主要依据员工在本单位的工作年限来确定，具体为每满一年支付一个月工资的经济补偿，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。

详细分析：

1. 经济补偿金的基本计算原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，经济补偿金是按照劳动者在本单位工作的年限来计算的。具体来说，每满一年支付一个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

2. 月工资的定义与计算：

   • 月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。如果劳动者工作不满12个月，则按实际工作的月数计算平均工资。
   • 需要注意的是，如果劳动者的月平均工资低于当地最低工资标准，应按照当地最低工资标准来计算经济补偿金。相反，如果劳动者的月平均工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，但支付年限最高不超过十二年。

3. 协商解除劳动合同的特殊性：

   • 在本案例中，员工与单位是协商解除劳动合同，而非单位单方面解除。尽管如此，经济补偿金的计算标准仍然适用上述规定。这是因为协商解除劳动合同也是劳动合同解除的一种方式，同样需要遵循相关法律法规的规定。

4. 具体计算示例：

   • 假设员工在单位工作了5年，劳动合同解除前十二个月的平均工资为8000元，且该工资未超过当地职工月平均工资的三倍。那么，单位应支付的经济补偿金为：5年 × 8000元/年 = 40000元。
   • 如果员工在单位工作了2年零4个月，劳动合同解除前十二个月的平均工资为6000元。那么，单位应支付的经济补偿金为：2年 × 6000元/年 + 0.5年 × 6000元/年（4个月按半个月计算） = 15000元。

其他注意事项：

• 在协商解除劳动合同的过程中，双方应确保解除程序的合法性，并签订书面的解除协议，以明确双方的权利和义务。
• 如果员工认为单位支付的经济补偿金不符合法律法规的规定，可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 员工在医疗期满后与单位协商解除劳动合同时，应了解自己的经济补偿金权益，并确保单位按照法律法规的规定支付经济补偿金。
• 如果员工对经济补偿金的计算有疑问或不确定，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律解释和计算建议。