针对您提出的“老板车子超载罚款由员工负责是否合法”的问题，这是一个涉及劳动法和交通安全法规的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确责任归属
首先，我们需要明确的是，超载是违法行为，无论是由谁指示或默许，都应当受到法律的制裁。然而，在劳动关系中，责任的归属并非简单的一刀切。如果您是在执行老板的工作任务过程中，按照其要求或默许进行超载，那么老板作为雇主，应当承担相应的管理责任。
二、法律分析
劳动法角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者对用人单位管理人员的违章指挥、强令冒险作业，有权拒绝执行，并有权提出批评、检举和控告。这意味着，如果您认为老板的要求违反了法律法规，您有权拒绝执行。
- 同时，如果因为执行老板的违章指挥而导致您受到损失（如驾照被扣、罚款等），您有权要求老板承担相应的赔偿责任。
交通安全法规角度：
- 超载是违反交通安全法规的行为，无论是由驾驶员还是车主（或雇主）负责，都应当受到相应的处罚。然而，在劳动关系中，如果超载行为是在老板的指示或默许下进行的，那么老板作为实际的控制人和受益人，应当承担更大的责任。
三、建议行动步骤
与老板沟通：
- 首先，您可以尝试与老板进行坦诚的沟通，说明超载的违法性和可能带来的后果，以及您因此可能面临的损失。希望老板能够认识到问题的严重性，并主动承担责任。
收集证据：
- 在沟通过程中，务必收集相关证据，如运输任务安排记录、货物装载照片、过磅单、与老板的沟通记录等。这些证据将有助于您在后续的法律程序中维护自己的权益。
寻求法律帮助：
- 如果老板拒绝承担责任，您可以向当地劳动监察部门投诉，详细说明事情经过和诉求，并附上相关证据材料。劳动监察部门有权调查核实情况，并要求老板提供相关资料和说明。
- 如果劳动监察部门的处理结果不满意，您还可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。在这些法律程序中，您需要提交充分的证据来支持自己的诉求。
四、总结与教训
无论最终结果如何，您都应从此次事件中吸取教训。在未来工作中，务必严格遵守交通法规和公司的规章制度，不执行任何违法违章的指令。同时，也要学会保护自己的合法权益，及时咨询专业律师并寻求法律帮助。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时告诉我。