结论：员工由您公司招聘到分包项目上工作，但与对方公司签订合同，这种安排是否合法，取决于多种因素，包括合同的具体内容、双方公司的意图、员工的知情权及同意情况等。以下从不同角度进行分析：
合同内容与双方意图：
- 如果合同明确约定了员工是为分包项目工作，且双方公司（您公司和对方公司）以及员工都清楚并同意这一安排，同时合同内容不违反法律法规的强制性规定，那么这种合同安排是合法的。
- 合同中应明确员工的职责、工作地点、薪酬支付方式、社保缴纳等关键条款，以确保员工的权益得到保障。
员工的知情权与同意：
- 员工在签订合同时，应充分了解合同内容，特别是关于工作性质、工作地点、薪酬及福利等关键信息。
- 如果员工在不知情或未同意的情况下被安排到分包项目工作，并与对方公司签订合同，这可能构成欺诈或误导，员工有权要求撤销合同或寻求法律救济。
法律法规的遵守：
- 双方公司在安排员工工作时，必须遵守国家关于劳动用工的法律法规，如《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等。
- 特别是关于劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等方面的规定，必须严格遵守，以确保员工的合法权益不受侵害。
潜在的法律风险：
- 如果合同安排存在瑕疵或违反法律法规，双方公司可能面临法律纠纷和行政处罚。
- 员工也可能因合同问题而遭受损失，如薪酬拖欠、社保未缴等，进而引发劳动争议和诉讼。
法律建议：
- 在安排员工到分包项目工作并与对方公司签订合同前，务必确保合同内容合法、合规，并充分保障员工的知情权和同意权。
- 双方公司应明确各自的责任和义务，特别是在薪酬支付、社保缴纳等方面，以避免潜在的法律风险。
- 如果员工对合同安排有疑问或不满，应及时与员工沟通并协商解决，以维护良好的劳动关系。
后续行动建议：
- 如果您公司已经或计划进行此类合同安排，建议对现有合同进行审查，确保符合法律法规要求。
- 如需进一步了解相关法律法规或处理具体法律问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。