行政机关合并后，职务的处理通常遵循“随职能、随编制、随人员”的原则，具体处理方式需结合合并类型、职能调整及人员安置政策综合判断。以下分情况详细说明：

1. 职能整合型合并：职务随职能调整

若合并是因职能整合（如A部门与B部门职能相近或互补），原职务通常按以下方式处理：

• 职务保留或合并：若合并后新机构仍需履行原职能，原职务可能保留或合并为新职务（如原“A部门政策处处长”与“B部门法规处处长”合并为“新机构政策法规处处长”）。
• 职务撤销或降级：若原职能被整合或取消，对应职务可能撤销或降级（如原“A部门专项审批科科长”因审批权下放，职务可能调整为“新机构业务科副科长”）。
• 人员竞聘上岗：部分岗位可能通过竞聘重新确定职务，原职务仅作为参考，最终以新机构岗位需求为准。

2. 机构撤销型合并：职务随人员安置

若合并涉及机构撤销（如A部门整体并入B部门），职务处理通常以人员安置为核心：

• 平级调任：原职务与新机构岗位匹配的，可能平级调任（如原“A部门办公室主任”调任为“B部门综合处处长”）。
• 职务降级或免职：若新机构无对应岗位或人员超编，原职务可能降级（如原“处级干部”调整为“科级岗位”）或免职（转为非领导职务或普通职员）。
• 优先安置原则：根据《公务员法》及地方政策，合并中通常优先安置原机构人员，职务调整需符合“编制限额和职务层次”要求，不得随意降低待遇。

3. 特殊情形：临时机构或改革试点合并

若合并为临时性机构（如专项改革领导小组）或试点项目，职务处理可能更灵活：

• 临时职务设定：原职务可能转为临时职务（如“原XX局局长”兼任“改革领导小组办公室主任”），任务结束后职务自动终止。
• 返岗安排：临时任务结束后，人员通常返回原单位或按新编制重新安排职务。

4. 法律依据与程序要求

• 编制管理：职务调整需符合《地方各级人民政府机构设置和编制管理条例》，不得超编设置职务。
• 民主程序：职务撤销、合并或降级需履行民主程序（如征求意见、公示），确保程序合法。
• 申诉救济：若对职务调整有异议，可依据《公务员申诉规定》向同级公务员主管部门或上一级机关提出申诉。

建议：行政机关合并中的职务处理涉及编制、职能、人员等多重因素，具体方案需以地方政策或合并文件为准。若您或所在单位面临此类问题，可直接向我咨询，我会结合合并类型、地方政策及个案细节提供针对性建议。