结论：在房屋租给他人且后期可能继续建其他房但不影响租客居住的情况下，协议中应明确双方的权利义务，特别是关于施工期间不影响租客居住的具体条款，以保障双方的合法权益。

详细解答：

1. 明确租赁物及用途：

   • 在协议中应明确租赁的房屋具体位置、面积、结构等信息，确保租客清楚了解租赁物的状况。
   • 同时，可以约定租赁物的用途，如居住、办公等，以及是否允许租客进行一定的装修或改造，但需注意，若涉及房屋结构改动，应事先征得房东同意并符合相关法律法规。

2. 施工期间的特别约定：

   • 鉴于后期可能继续建其他房，协议中应明确施工期间的具体时间、施工范围、施工方式等，以及这些施工活动对租客居住的具体影响。
   • 重要的是，要约定施工期间房东应采取的措施，以确保租客的正常居住不受影响，如设置隔音屏障、合理安排施工时间等。
   • 还可以约定，若因施工导致租客无法正常居住，房东应承担的责任，如提供临时住宿、减免租金等。

3. 租金及支付方式：

   • 协议中应明确租金的金额、支付方式、支付时间等，确保双方对租金有清晰的了解。
   • 若因施工导致租客居住环境发生变化，双方可以协商调整租金，但应在协议中明确调整的条件和方式。

4. 维修与保养责任：

   • 协议中应明确房屋及附属设施的维修与保养责任，包括日常维修和因施工导致的损坏维修。
   • 若因施工导致房屋或附属设施损坏，房东应及时修复，并承担修复费用。

5. 违约责任：

   • 协议中应明确双方的违约责任，包括未按时支付租金、未履行维修义务、违反施工期间约定等。
   • 违约责任应具体、明确，以便在发生违约情况时，双方能够依据协议进行处理。

6. 协议变更与解除：

   • 协议中应约定协议变更与解除的条件和程序，以便在需要变更或解除协议时，双方能够按照约定进行处理。
   • 特别是针对施工期间可能出现的特殊情况，如施工延期、施工范围扩大等，双方可以约定相应的协议变更或解除条款。

示例条款： “施工期间特别约定：甲方（房东）承诺在施工期间采取必要措施，确保乙方（租客）的正常居住不受影响。施工时间为每日XX时至XX时，避免在乙方休息时间进行噪音较大的施工活动。若因施工导致乙方无法正常居住，甲方应提供临时住宿或减免相应租金。施工期间，甲方负责修复因施工导致的房屋或附属设施损坏，并承担修复费用。”

后续建议：

• 在签订协议前，双方应充分沟通，确保对协议内容有清晰、一致的理解。
• 协议签订后，双方应严格按照协议履行各自义务，避免发生纠纷。
• 若在履行过程中发生争议，双方应首先协商解决；协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。

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