事业单位员工的公休未休补助在离职后是否会补发，这主要取决于员工与单位之间的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
法律法规层面：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利，单位应当保证劳动者享受法定的休息休假。如果单位因工作需要不能安排劳动者休假的，应当按照法律规定支付相应的工资报酬或补休。
- 对于事业单位员工，其休假及工资福利等通常受到《事业单位人事管理条例》等法规的调整。这些法规可能具体规定了未休假补助的支付条件和方式。但目前并没有一个统一的、直接针对事业单位员工离职后公休未休补助是否补发的明确规定。这往往需要根据具体的地方性法规、单位规章制度或劳动合同中的约定来确定。
单位规章制度与劳动合同层面：
- 事业单位通常会制定自己的规章制度，其中可能包含关于员工休假、工资福利以及离职后相关待遇的具体规定。如果规章制度中明确规定了离职后公休未休补助的补发方式，那么单位应当按照规章制度执行。
- 劳动合同是员工与单位之间约定双方权利和义务的重要文件。如果劳动合同中明确约定了离职后公休未休补助的补发条款，那么单位也应当按照劳动合同的约定执行。
实际操作与协商层面：
- 在实际操作中，如果员工离职时存在公休未休的情况，且单位没有明确的规章制度或劳动合同约定补发补助，那么员工可以与单位进行协商，争取达成补发补助的协议。
- 如果协商无果，员工还可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，比如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
建议：
- 对于事业单位员工来说，在离职前最好与单位明确沟通并确认公休未休补助的补发问题，以避免后续产生纠纷。
- 如果单位拒绝补发或双方无法达成一致意见，员工可以咨询专业律师（比如我，李光勇律师，专注于婚姻家庭、劳动纠纷、合同纠纷、法律顾问领域），了解自己的权益和可行的维权途径。
综上所述，事业单位员工的公休未休补助在离职后是否会补发并没有一个固定的答案，而是需要根据具体情况来判断。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。