在发回重审的案件中，通常不能重新提出诉讼时效抗辩，但存在特定例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则
诉讼时效抗辩的提出时机：
- 根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第三条，当事人在一审期间未提出诉讼时效抗辩，在二审期间提出的，人民法院原则上不予支持。这一规定同样适用于发回重审的案件，因为发回重审并非一个独立的审级，而是原一审程序的延续。
维护诉讼程序的稳定性和效率性：
- 允许当事人在发回重审时随意提出之前未主张的诉讼时效抗辩，可能会导致诉讼程序的不稳定和拖延，影响司法效率和司法权威。因此，法院通常会严格审查当事人未在原审一审提出抗辩的原因是否合理。
二、特定例外情况
基于新证据的抗辩：
- 如果当事人在发回重审期间提出了基于新证据的诉讼时效抗辩，且该新证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间，那么法院可能会支持这一抗辩。例如，被告在重新审理过程中找到了新的证据，如证人证言或书面材料，能证明原告在借款到期后很长时间内从未向其主张过权利，此时被告就可以基于该新证据提出诉讼时效抗辩。
一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误：
- 如果二审法院认为一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误，或者一审法院违反法律规定导致当事人未行使诉讼时效抗辩权的，二审法院可以在查清事实后对诉讼时效问题作出改判，或者直接改判驳回原告的诉讼请求。这种情况下，发回重审后，被告也有权提出诉讼时效抗辩。
三、实际操作建议
充分准备证据材料：
- 如果当事人希望提出诉讼时效抗辩，应尽可能在一审期间提出，并充分准备相关证据材料。如果因故未能在一审期间提出，且希望在发回重审时提出，则必须确保有新的证据支持其抗辩理由。
咨询专业律师：
- 在实际操作中，由于诉讼时效抗辩的提出涉及复杂的法律问题和证据规则，因此当事人应咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专业律师，我可以根据案件的具体情况，为当事人提供针对性的法律策略和建议。
总结来说，发回重审的案件中，通常不能重新提出诉讼时效抗辩，但存在基于新证据或一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误等特定例外情况。因此，当事人在提出诉讼时效抗辩时，应充分考虑这些因素，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。