在发回重审的案件中，被告确实可以提出诉讼时效抗辩，但这一权利的行使需遵循一定的法律规则和司法实践原则。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与解释

1. 《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第三条：

   • 当事人在一审期间未提出诉讼时效抗辩，在二审期间提出的，人民法院原则上不予支持，除非其基于新的证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间。这一规定同样适用于发回重审的情况。即，若当事人在原审一审期间未提出诉讼时效抗辩，原则上在重审时也不能随意提出，但若能提供新的证据证明对方请求权已过诉讼时效期间，则可以提出抗辩。

2. 二审法院的审查与改判原则：

   • 如果二审法院认为一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误，或者一审法院违反法律规定导致当事人未行使诉讼时效抗辩权的，二审法院可以在查清事实后对诉讼时效问题作出改判，或者直接改判驳回原告的诉讼请求。这一原则在发回重审的案件中同样适用。

二、司法实践中的考量

1. 保障程序安定性：

   • 允许当事人在发回重审时随意提出之前未主张的诉讼时效抗辩，可能会导致诉讼程序的不稳定和拖延，影响司法效率和司法权威。因此，法院通常会严格审查当事人未在原审一审提出抗辩的原因是否合理，以及新证据是否确实能够证明对方请求权已过诉讼时效期间。

2. 公平保护当事人权益：

   • 在有新的证据出现，使得诉讼时效问题有了新的认定可能的情况下，允许当事人提出诉讼时效抗辩，是为了保障当事人的合法权益，确保案件能够得到公正的处理。例如，如果被告在重新审理过程中找到了新的证据，如证人证言或书面材料，能证明原告在借款到期后很长时间内从未向其主张过权利，此时被告就可以基于该新证据提出诉讼时效抗辩。

3. 一审法院的重新审理义务：

   • 在发回重审的情况下，一审法院应当重新对案件进行审理，包括对诉讼时效的审查。此时，被告完全有权在重新审理的过程中提出诉讼时效抗辩，并且法院也应当依法进行审理和裁判。

三、具体建议

• 被告方：若您打算在发回重审时提出诉讼时效抗辩，请务必准备充分的证据材料，以证明原告的请求权已过诉讼时效期间。同时，您也需要了解并遵守相关的法律程序和规定，以确保您的抗辩能够得到法院的支持。
• 原告方：若您担心被告会在发回重审时提出诉讼时效抗辩，您可以提前准备相关证据，以证明您的请求权仍在诉讼时效期间内。此外，您也可以咨询专业律师，了解如何应对被告可能提出的诉讼时效抗辩。

综上所述，被告在发回重审时提出诉讼时效抗辩是符合法律规定的，但须注意其提出的时机、依据以及法院对此的审查和裁判原则。在实际操作中，当事人应充分准备相关证据材料，并遵循法律程序和规定。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。