招标代理费由中标单位支付这一做法，主要违反了《中华人民共和国招标投标法》中关于招标代理服务费用承担的规定。具体来说：

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，招标代理服务费用通常应由招标人承担。这是因为招标代理机构是受招标人的委托，为其提供招标代理服务的，其服务费用自然应由委托人，即招标人支付。

2. 违规后果：

   • 如果招标文件或相关合同中规定由中标单位支付招标代理费，这实际上是将本应由招标人承担的费用转嫁给了中标单位，这种做法可能构成对中标单位的不公平待遇，违反了招标投标活动的公平、公正原则。
   • 此外，如果中标单位因此提出异议或投诉，相关监管部门可能会对此进行调查，并可能要求招标人纠正其违规行为，甚至可能对招标人进行处罚。

3. 实际操作建议：

   • 招标人在编制招标文件时，应明确招标代理服务费用的承担方，并确保该规定符合相关法律法规的要求。
   • 如果招标人确实希望由中标单位承担部分或全部招标代理服务费用，应在招标文件中明确说明，并确保这种安排不会违反相关法律法规的规定，同时也不会对中标单位构成不公平待遇。然而，在大多数情况下，这种做法并不被推荐，因为它可能引发争议和投诉。

4. 特殊情况说明：

   • 当然，也存在一些特殊情况或地区性规定，可能允许或要求中标单位承担部分招标代理服务费用。但这种情况通常需要在招标文件中明确说明，并确保符合当地法律法规的要求。在没有明确法律规定或合同约定的情况下，将招标代理费转嫁给中标单位是不合法的。

总结来说，招标代理费由中标单位支付这一做法，在大多数情况下是违反《中华人民共和国招标投标法》的。招标人应确保招标代理服务费用的承担方符合相关法律法规的要求，以避免可能的法律风险和争议。如果您在招标投标过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。