结论：没有食品许可证被罚款5000元是否合法，需结合具体情况判断，但通常情况下，未取得食品经营许可证从事食品经营活动，罚款金额会远高于5000元，不过也存在从轻、减轻处罚或免予处罚的可能性。

详细分析：

1. 一般情况下的罚款标准：

   • 根据《中华人民共和国食品安全法》第一百二十二条，未取得食品生产经营许可从事食品生产经营活动的，若违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额不足一万元，将并处五万元以上十万元以下罚款；若货值金额一万元以上，将并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。
   • 这意味着，在一般情况下，没有食品许可证从事食品经营活动，罚款金额会远高于5000元。

2. 从轻、减轻处罚或免予处罚的情形：

   • 从轻或减轻处罚：如果违法行为情节轻微，如初次违法、及时改正且未造成危害后果，或者存在其他法定从轻、减轻处罚的情形，监管部门可能会在法定幅度内从轻或减轻处罚。但即便如此，罚款金额也通常不会低至5000元，除非货值金额极小且情节特别轻微。
   • 免予处罚：根据《中华人民共和国食品安全法》第一百三十六条，如果食品经营者履行了进货查验等义务，有充分证据证明其不知道所采购的食品不符合食品安全标准，并能如实说明其进货来源，可以免予处罚。但这种情况较为特殊，且仍需依法没收不符合标准的食品，并可能需承担损害赔偿责任。

3. 5000元罚款的合法性分析：

   • 如果实际罚款金额为5000元，且该金额是在考虑了违法行为的情节、货值金额、社会危害程度等因素后，由监管部门在法定幅度内酌情决定的，那么该罚款可能是合法的。但这种情况较为罕见，因为通常罚款金额会远高于此。
   • 另一种可能是，该5000元罚款并非仅因未取得食品许可证而处罚，而是结合了其他违法行为或情节（如销售少量过期食品、标签不规范等）进行的综合处罚。在这种情况下，罚款金额可能相对较低。

建议：

• 如果您或您的企业因未取得食品许可证而被罚款5000元，建议首先核实罚款依据和具体情节，了解监管部门作出该处罚决定的理由和依据。
• 如果您认为罚款金额不合理或存在其他争议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。
• 为避免类似情况再次发生，建议尽快办理食品经营许可证，确保合法合规经营。

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