结论：已经和包工头达成赔偿协议后，能否再找建筑公司，这取决于多个因素，包括赔偿协议的内容、建筑公司是否应承担责任以及法律程序的要求等。以下从不同角度进行分析：
一、赔偿协议的内容与效力
协议内容：首先，需要仔细审查与包工头签订的赔偿协议。如果协议中明确约定了赔偿的范围、金额以及双方的权利义务，并且该协议是双方真实意思的表示，没有违反法律法规的强制性规定，那么该协议通常具有法律效力。
协议效力对建筑公司的影响：如果赔偿协议已经涵盖了您因工程问题所遭受的全部损失，并且您已经接受了包工头的赔偿，那么在没有其他法定事由的情况下，您可能难以再向建筑公司主张额外的赔偿。因为，从法律上讲，您已经通过赔偿协议获得了相应的补偿。
二、建筑公司的责任
建筑公司的直接责任：如果建筑公司作为工程的总承包方或发包方，对工程的质量、安全等问题负有直接责任，并且这些问题导致了您的损失，那么您有权向建筑公司主张赔偿。但是，这通常需要在您与包工头的赔偿协议之外，另行通过法律途径进行主张。
建筑公司与包工头的责任划分：如果建筑公司与包工头之间存在明确的责任划分，并且包工头已经根据其责任范围对您进行了赔偿，那么您再向建筑公司主张赔偿时，需要证明建筑公司存在超出包工头责任范围的过错或责任。
三、法律程序的要求
诉讼时效：如果您决定向建筑公司主张赔偿，需要注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。因此，您需要在知道或应当知道自己的权利受到侵害之日起三年内提起诉讼。
证据收集：在主张赔偿时，您需要收集充分的证据来证明建筑公司的过错或责任。这可能包括工程合同、施工记录、质量检测报告、现场照片、证人证言等。
四、实际操作建议
审查赔偿协议：首先，仔细审查与包工头签订的赔偿协议，确保协议内容明确、合法有效。
咨询专业律师：如果您对赔偿协议的内容、建筑公司的责任或法律程序有疑问，建议咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。
考虑和解或调解：在向建筑公司主张赔偿时，您可以考虑通过和解或调解的方式解决纠纷。这通常可以更快地解决问题，并减少诉讼成本和时间。
准备法律诉讼：如果和解或调解无法达成一致，您需要准备法律诉讼。这包括收集证据、撰写诉状、参加庭审等步骤。在这个过程中，律师的协助将至关重要。
最后，已经和包工头达成赔偿协议后能否再找建筑公司，取决于多个因素的综合考虑。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。