医院辅助岗同工不同酬一般是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律背景
根据《中华人民共和国劳动法》第四十六条的规定，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。这意味着，在同一单位内，从事相同工作、付出等量劳动且取得相同劳动业绩的劳动者，应获得相同的劳动报酬。医院辅助岗作为医院运营中不可或缺的一部分，其员工同样享有这一权利。
具体分析
同工同酬的适用范围：
- 同工同酬原则适用于所有用人单位，包括医院等事业单位。无论劳动者是正式员工还是辅助岗员工，只要他们从事相同的工作，付出等量的劳动，并取得相同的劳动业绩，就应当获得相同的报酬。
同工不同酬的违法性：
- 如果医院辅助岗员工与正式员工从事相同的工作，但报酬不同，且这种差异并非基于合理的因素（如工作年限、技能水平、工作表现等），而是基于身份、岗位性质等不合理因素，那么这种差异就构成了同工不同酬，是违法的。
可能的法律后果：
- 如果医院存在同工不同酬的情况，辅助岗员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求医院支付同工同酬的差额部分。
- 在仲裁过程中，员工需要提供证据证明自己与正式员工从事相同的工作、付出等量的劳动，并取得相同的劳动业绩，但报酬却存在差异。
- 如果仲裁裁决支持员工的诉求，医院需要按照裁决结果支付差额部分，并可能面临其他法律责任，如罚款、声誉损害等。
法律建议
收集证据：
- 如果你作为医院辅助岗员工，认为自己的报酬与正式员工存在不合理差异，首先应当收集相关证据，如工作记录、工资单、劳动合同等，以证明自己与正式员工从事相同的工作、付出等量的劳动，并取得相同的劳动业绩。
与医院协商：
- 在收集到足够证据后，你可以尝试与医院进行协商，要求医院支付同工同酬的差额部分。如果医院同意协商并解决问题，那么这是最快捷、最经济的解决方式。
申请仲裁或提起诉讼：
- 如果协商无果，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求医院支付同工同酬的差额部分。如果对仲裁结果不满，你还可以向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
特殊情况说明
虽然同工同酬是原则，但在实际操作中，也可能存在一些特殊情况导致报酬差异。例如，如果辅助岗员工与正式员工在工作内容、工作强度、工作风险等方面存在实质性差异，或者辅助岗员工的工作经验、技能水平、工作表现等明显低于正式员工，那么这种报酬差异可能是合理的。然而，这种差异必须基于客观、合理的因素，并且需要得到员工的认可或经过合法程序的确定。
总之，医院辅助岗同工不同酬一般是不合法的。如果你作为辅助岗员工认为自己的报酬与正式员工存在不合理差异，应当积极收集证据并寻求法律途径维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。