针对省督察组查岗时不在岗的情况，需根据具体原因和单位规章制度来处理，以下分情况说明：
若因正当理由不在岗：
- 及时沟通与说明：首先，应立即与上级领导或督察组相关负责人取得联系，说明不在岗的具体原因，如因公外出、参加会议、处理紧急事务等，并提供相应的证明材料，如会议通知、外出审批单等。
- 遵守补岗程序：根据单位规定，可能需要填写不在岗情况说明表或进行其他形式的补岗登记，以确保单位对人员动态的掌握。
- 避免再次发生：未来应更加注意工作时间的安排，确保在督察组查岗等关键时刻在岗，或提前做好请假、报备等手续。
若因无正当理由不在岗：
- 接受纪律处分：根据单位规章制度，无正当理由不在岗可能构成旷工或违反工作纪律，将面临相应的纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。
- 承担相应责任：除了纪律处分外，还可能因不在岗导致的工作延误、损失等承担相应的经济或法律责任。
- 积极改正态度：在接受处分的同时，应表现出积极改正的态度，承诺未来严格遵守单位规章制度，确保不再发生类似情况。
单位应采取的措施：
- 完善考勤制度：单位应建立健全的考勤制度，明确查岗的时间、方式、要求等，确保查岗工作的规范性和有效性。
- 加强员工教育：通过培训、会议等方式，加强对员工的纪律教育，提高员工对查岗工作的重视程度和遵守规章制度的自觉性。
- 公正处理事件：在处理不在岗事件时，单位应坚持公正、公平、公开的原则，根据事实和规章制度进行严肃处理，同时保障员工的合法权益。
建议：无论是因何种原因不在岗，都应积极与单位沟通，说明情况并接受相应处理。同时，单位也应加强管理，完善制度，确保查岗工作的顺利进行和员工权益的保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。