针对巡查组查岗时不在岗的情况，处理方式需结合具体情节、单位规章制度及法律法规综合判断，以下是分情况说明：

1. 若属于临时性、合理原因不在岗（如外出执行任务、紧急公务等）
   需提前向直接领导或巡查组报备，并保留相关证据（如工作记录、通讯记录等）。若未报备但能证明事由合理，通常可免于处罚，但需补办手续（如事后说明情况、补签外出单等）。
   法律依据：根据《公务员法》或单位内部考勤制度，员工因公外出需履行审批程序，未审批但符合“紧急情况”或“工作需要”的，可事后补正。

2. 若属于无故缺勤、擅自离岗（无合理事由且未报备）
   可能面临以下处理：

   • 行政处分：根据情节轻重，可能被警告、记过、降级甚至辞退（如《公务员处分条例》规定，旷工或因公外出逾期不归连续超过15天可辞退）；
     
   • 绩效扣分：单位内部考核制度可能将缺勤与奖金、晋升挂钩；
     
   • 经济处罚：部分单位会扣发当日工资或全勤奖。
     关键点：单位需有明确规章制度，且处罚需与违规程度匹配，避免“过度处罚”（如仅因1次缺勤直接辞退可能违法）。

3. 若涉及特殊岗位或行业（如医疗、安保、生产安全等）
   因脱岗可能引发重大风险，处罚可能更严厉。例如：

   • 医护人员脱岗导致患者损害，可能承担民事赔偿甚至刑事责任（《刑法》第三百三十五条“医疗事故罪”）；
     
   • 安保人员脱岗导致安全事故，单位可能被追责，个人可能面临行政处罚或行业禁入。
     建议：此类岗位需严格遵守值班制度，脱岗前务必交接工作并留痕。

4. 若对处理结果有异议
   可通过以下途径维权：

   • 内部申诉：向单位工会、纪检监察部门提出书面申诉，要求复核；
     
   • 劳动仲裁：若认为处罚违法（如无制度依据、程序违法），可申请仲裁撤销处罚；
     
   • 行政诉讼：对仲裁结果不服的，可向法院起诉（适用于公务员或事业单位人员）。
     

温馨提示：

• 单位制度需经民主程序制定并公示，否则可能无效；
  
• 处罚需留存书面证据（如签收单、会议记录），避免口头处罚；
  
• 若因脱岗被追责，可主张“不可抗力”或“紧急避险”等免责事由（需充分证据支持）。
  

如有具体情节（如脱岗时间、原因、单位性质等），可进一步向我说明，我会结合案例为您详细分析。