事业单位查岗不在的处罚需依据单位规章制度及具体情节确定，一般可能涉及警告、记过、降级、撤职甚至开除等处分，具体需结合单位规定和实际情况判断。以下从不同角度详细分析：

1. 单位规章制度层面
   事业单位对员工的考勤管理通常有明确的规章制度，例如《员工考勤管理办法》或《岗位责任制》等。若单位规定查岗时不在岗属于旷工或违反工作纪律，则可能依据制度给予相应处罚。

   • 轻微情节：首次或情节较轻的，可能给予口头警告、书面警告或通报批评；
     
   • 较重情节：多次违反或情节严重的，可能给予记过、降级、撤职等处分；
     
   • 严重情节：若因不在岗导致严重后果（如安全事故、重大工作失误等），可能构成“严重违反单位规章制度”，单位有权解除劳动合同（开除）。

2. 法律法规层面
   根据《事业单位人事管理条例》第二十八条，事业单位工作人员有“旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归”等情形的，单位可给予处分。若旷工连续超过15个工作日，或1年内累计旷工超过30个工作日，单位可解除聘用合同。

   • 关键点：处罚需以“事实清楚、证据充分”为前提，单位需证明员工不在岗的事实（如查岗记录、监控录像等）；
     
   • 程序要求：处罚需遵循法定程序，例如告知员工处罚理由、听取其陈述申辩、经单位负责人集体讨论决定等。

3. 特殊情形处理

   • 因公外出：若员工因公外出（如开会、调研等）且已履行审批手续，则不属于“不在岗”，单位不得处罚；
     
   • 请假未获批：若员工已提交请假申请但未获批擅自离岗，可能被认定为旷工；
     
   • 不可抗力：因突发疾病、交通事故等不可抗力导致无法到岗的，需提供证明材料，单位应酌情处理。

建议：若您或您所在单位涉及此类问题，可进一步提供具体情节（如单位规定、不在岗原因、是否造成后果等），以便更精准分析。如有疑问，可直接向我咨询。