建设工程挂靠公司收取管理费是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律层面
合同效力：
- 根据我国《建筑法》等相关法律法规，建设工程挂靠合同因违反法律的强制性规定而无效。挂靠行为本质上是一种欺诈行为，它以虚假身份或资质参与市场竞争，违背了公平、公正的市场原则。因此，基于该无效合同所约定的管理费条款，原则上也不具有法律效力。
法律后果：
- 挂靠行为一旦被发现，相关方将面临严厉的行政处罚，包括但不限于罚款、降低资质等级、吊销资质证书等。此外，如果因挂靠工程出现质量安全事故等问题，还可能需要承担相应的民事赔偿责任和刑事责任。
二、司法实践层面
管理费的处理争议：
- 在司法实践中，对于管理费的处理存在不一致的情况。部分法院认为，若被挂靠人在一定程度上参与了工程项目管理，如质量监督、技术指导等，可参照合同约定，结合其实际管理投入情况，判令挂靠人支付一定比例的管理费。然而，另一些法院则认为，挂靠行为本身违法，被挂靠人不应从违法行为中获利，因此不支持支付管理费。
裁判原则：
- 法院在裁决时会综合考虑被挂靠人的实际管理投入、挂靠行为的严重程度以及市场秩序等因素，作出是否支持支付管理费及支付比例的判决。这体现了法院在处理此类纠纷时的灵活性和公正性。
三、实际操作建议
避免挂靠行为：
- 鉴于挂靠合同的无效性和潜在的法律风险，建议企业和个人避免采取挂靠方式进行工程承包。应努力提升自身资质和实力，以合法合规的方式参与市场竞争。
合法合作模式：
- 对于确实需要合作完成的项目，双方应签订合法的合作协议，并明确各自的管理职责、权利义务以及费用支付方式。确保合同内容合法且具有可操作性，以降低法律风险。
证据准备与维权：
- 若已发生挂靠行为并产生管理费纠纷，双方应积极收集证据。被挂靠人应证明自身实际参与了项目管理及投入，而挂靠人则应证明被挂靠人未履行管理义务或管理存在重大瑕疵。在维权过程中，务必遵循法律程序，确保自身权益得到合法保护。
四、案例警示
- 在实际案例中，法院对管理费的处理方式各不相同。有案例显示，被挂靠人虽未直接参与施工，但因提供了必要的资质支持和管理服务，法院支持了其收取一定比例的管理费。然而，也有案例因被挂靠人未履行任何管理义务，法院驳回了其收取管理费的请求。这些案例表明，法院在处理此类纠纷时，会依据个案的具体情况进行裁量。
综上所述，建设工程挂靠公司收取管理费是不合法的，且存在严重的法律风险。为避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议企业和个人严格遵守相关法律法规，通过合法途径取得资质并承接工程。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。