劳动合同中约定26天工作制，确实可能影响工资结算，但具体影响取决于劳动合同中的工资结构条款以及是否违反了法律法规的强制性规定。以下从不同角度进行分析：
一、合法性角度
法定工作时间：根据《劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。若劳动合同中约定的26天工作制，导致劳动者每周工作时间超过法定标准，则该约定可能因违反法律强制性规定而无效。
加班工资：如果26天工作制中包含了加班时间，那么用人单位应当按照法律规定支付加班工资。加班工资的计算通常基于劳动者的基本工资和加班时长。若劳动合同中未明确加班工资的计算方式，或者计算方式低于法定标准，劳动者有权要求用人单位补足差额。
二、工资结构角度
固定工资与绩效工资：如果劳动合同中约定的是固定工资，且26天工作制并未导致劳动者实际工作时间超过法定标准，那么工资结算通常不会受到影响。然而，如果劳动合同中包含了绩效工资部分，且绩效工资的计算与工作时间或工作量直接相关，那么26天工作制可能会影响绩效工资的结算。
工资总额与构成：劳动合同中应明确工资总额及其构成，包括基本工资、加班工资、奖金、津贴等。如果26天工作制导致加班工资成为工资总额的重要组成部分，那么工资结算将直接受到加班时长和加班工资计算方式的影响。
三、实际操作角度
工资结算周期：用人单位通常按照月为周期进行工资结算。如果劳动合同中约定的26天工作制跨越了工资结算周期，用人单位需要确保在结算周期内准确计算劳动者的工作时间和加班工资，以避免工资结算错误。
工资条与记录：用人单位应向劳动者提供详细的工资条，记录工资总额、各项构成、加班时长及加班工资等信息。这有助于劳动者了解自己的工资情况，并在必要时维护自己的合法权益。
四、建议与注意事项
审查劳动合同：劳动者在签订劳动合同时，应仔细审查合同中的工作时间、工资结构等条款，确保自己的权益不受侵害。
保留证据：劳动者应保留与工作时间、工资结算相关的证据，如工资条、考勤记录等，以便在发生纠纷时维护自己的权益。
及时沟通：如果劳动者对工资结算有疑问或不满，应及时与用人单位沟通，寻求解决方案。
法律途径：如果沟通无果，劳动者可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，劳动合同中约定26天工作制对工资结算的影响取决于多个因素，包括合法性、工资结构、实际操作等。劳动者在签订劳动合同时应谨慎审查相关条款，并在必要时寻求法律帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。