结论：员工被认定为工伤且发生轻微伤时，公司需要承担的责任主要包括支付工伤医疗费用、停工留薪期工资、护理费（如需要）以及配合员工进行工伤认定和赔偿申请等。以下是对这些责任的详细解释：
支付工伤医疗费用：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，员工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。这意味着，员工在工伤治疗期间产生的医疗费用，包括挂号费、检查费、治疗费、药费、住院费等，应由公司承担（若公司已为员工缴纳工伤保险，则部分费用可能由工伤保险基金支付，但公司仍需承担一定责任，如先行垫付等）。
支付停工留薪期工资：
- 员工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。这意味着，即使员工因工伤暂时无法工作，公司仍需支付其工资，以保障其基本生活。
支付护理费（如需要）：
- 如果员工在工伤治疗期间需要护理，且生活不能自理，公司应支付护理费。护理费的支付标准通常根据员工的实际需要和当地的护理市场价格来确定。
配合员工进行工伤认定和赔偿申请：
- 公司应积极配合员工进行工伤认定和赔偿申请工作，包括提供必要的证明材料、协助员工填写相关表格等。这是公司的法定义务，也是保障员工合法权益的重要环节。
额外建议：
- 及时沟通：公司应与员工保持及时沟通，了解其工伤治疗情况和需求，以便及时提供必要的帮助和支持。
- 完善制度：公司应完善工伤保险制度，确保员工在发生工伤时能够及时获得医疗救治和经济补偿。
- 预防为主：公司应加强安全生产管理，预防工伤事故的发生，减少员工和公司的损失。
可能后果：
- 如果公司未依法承担上述责任，员工有权向劳动保障行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任。
- 在严重情况下，公司还可能面临行政处罚或民事赔偿等法律后果。
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