针对您提出的“员工怀孕不来上班怎么办”的问题，这是一个涉及员工权益保护和公司管理规定的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：

一、初步沟通与核实情况

首先，公司应主动与怀孕员工取得联系，通过温和关切的方式询问其不上班的具体原因及身体状况。这一步骤至关重要，它体现了公司对员工的关心和支持，同时也有助于后续处理方案的制定。在沟通过程中，可以要求员工提供医院诊断书、病假条等必要证明材料，以确认其请假需求的合理性。

二、根据具体情况采取相应措施

1. 病假处理：

   • 如果员工提供了正规医院开具的病假条，并符合公司病假申请流程，那么公司应依法按病假处理。根据相关规定，病假工资或疾病救济费不得低于当地最低工资标准的80%。同时，公司需要明确员工享有的病假期限，如长期休病假超过规定期限，需进一步与员工沟通协商。

2. 产假安排：

   • 女职工生育享受至少98天产假，难产或多胞胎生育可增加产假天数。各地可能有额外奖励政策，公司需准确了解并告知员工。在产假安排上，公司应确保员工知晓产假申请所需的材料和流程，如填写申请表、提供预产期证明等。如果公司已为员工缴纳生育保险，产假期间的生育津贴将由生育保险基金支付；如果未缴纳，则产假期间的工资应由公司按照女职工产假前的工资标准支付。

3. 旷工管理：

   • 如果员工无正当理由且未履行请假手续而一直不上班，公司可认定为旷工。在处理旷工时，务必严格遵循公司规章制度和法律法规，确保有充分证据证明旷工事实，并已履行必要的通知程序。旷工期间，公司有权不支付工资，并根据规章制度进行相应处理。

三、协商灵活解决方案

考虑到怀孕员工的特殊情况，公司可以与其协商灵活工作安排，如远程办公、调整工作时间等，以满足员工需求并保证工作正常进行。双方应签订相关协议明确细节，确保双方权益得到保障。此外，根据员工身体状况和工作能力，公司还可以共同探讨职业发展规划的调整，如暂时调整工作岗位至强度较低、压力较小的岗位，并确保薪酬待遇合理公平。

四、寻求专业法律支持

在处理过程中，如遇复杂情况或难以抉择的问题，公司应咨询专业劳动法律师，获取更具针对性的建议和指导。这有助于确保处理方式的合法性和合理性，避免劳动纠纷的发生。

五、保持沟通与记录

在整个处理过程中，公司应与怀孕员工保持密切沟通，了解其具体情况和需求变化。同时，所有沟通和处理过程都应以书面形式记录并保存好相关证据，以备后续可能出现的劳动纠纷之需。

综上所述，对于员工怀孕不来上班的情况，公司应综合考虑法律法规、公司制度以及员工实际情况，通过沟通、协商和必要时的法律支持来妥善处理此类问题。这样既能维护公司的正常运营秩序，又能保障怀孕员工的合法权益。