若村书记在试用期内被认定为不合格，通常的处理方式是依法解除其职务或不再续聘，具体需结合当地规定和程序进行。以下是详细分析：

1. 试用期不合格的认定依据
   村书记的试用期考核需依据《村民委员会组织法》及地方性法规（如《XX省村民委员会选举办法》）进行。若试用期考核未达标（如未履行职责、群众满意度低、存在违纪行为等），乡镇政府可指导村集体启动调整程序。需注意：考核标准需提前公示，程序需公开透明，避免主观随意性。

2. 处理程序的关键步骤

   • 民主评议：由村民代表会议或村民大会对村书记试用期表现进行评议，形成书面意见。
     
   • 乡镇审核：村委会将评议结果报乡镇党委、政府审核，确认是否符合解除职务条件。
     
   • 职务终止：经审核通过后，由村民会议或村民代表会议依法罢免，或由乡镇政府直接宣布不再续聘（需符合地方规定）。
     
   • 备案与公示：处理结果需报县级民政部门备案，并在村内公示，保障村民知情权。

3. 法律风险防范

   • 程序合法性：若未履行法定程序（如未召开村民会议、未提前告知考核标准），可能引发行政诉讼或村民上访。
     
   • 证据固定：对试用期不合格的认定需留存书面记录（如考核表、评议记录、违纪证据等），避免口头决定。
     
   • 救济途径告知：若村书记对处理结果有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，乡镇政府需提前告知其权利。

4. 特殊情形处理

   • 试用期延长：若因不可抗力（如疫情）导致考核无法完成，可按地方规定延长试用期，但需经村民会议同意并报乡镇备案。
     
   • 补选程序：职务终止后，需在6个月内依法补选新任村书记，确保村务正常运转。

建议：若涉及具体操作（如考核标准制定、程序合规性审查），可进一步提供细节，我将结合《村民委员会组织法》及地方性法规为您制定方案。