结论：在公司任职文员，帮助公司做假账给对方公司结账，一旦追究起来，文员很可能会受到连累，面临法律责任。
分析如下：
法律责任的角度：
- 做假账是一种违法行为，可能涉及伪造、变造会计凭证、会计账簿，编制虚假财务会计报告等行为。根据《中华人民共和国会计法》的相关规定，这些行为都是被明确禁止的，并会受到相应的法律制裁。
- 文员作为公司的一员，如果参与了做假账的行为，即使只是执行上级的指示，也可能被视为共同违法者，需要承担相应的法律责任。这包括但不限于罚款、行政处罚，甚至可能涉及刑事责任，如被追究伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪或提供虚假证明文件罪等（具体罪名需根据实际情况和法律规定判断）。
职务行为与个人行为的区分：
- 虽然文员是在公司任职期间进行的这些行为，但职务行为并不总是能成为免除个人法律责任的理由。如果文员的行为超出了其职务范围，或者明知是违法行为而仍然执行，那么其个人很可能需要承担法律责任。
- 在实践中，法院或相关执法机构会综合考虑文员的职位、职责、行为性质、主观故意等因素，来判断其是否应承担法律责任以及承担何种程度的法律责任。
实际案例与司法实践：
- 在司法实践中，已经有多起因做假账而被追究法律责任的案例。这些案例中，不仅公司的高管和财务人员受到了处罚，一些直接参与做假账的普通员工也未能幸免。
- 因此，文员不能因为自己的职位较低或只是执行上级指示就认为可以逃避法律责任。在法律面前，每个人都是平等的，都需要对自己的行为负责。
建议：
- 如果文员已经参与了做假账的行为，应立即停止并主动向公司高层或相关部门反映情况，寻求解决方案。
- 如果担心自己的法律责任，可以咨询专业律师（即向我咨询，我专注于公司事务领域，可以为你提供专业的法律意见），了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
- 在未来的工作中，应严格遵守法律法规和公司规章制度，不参与任何违法行为，保护自己的合法权益。