在确认亲子关系之诉中，若法院启动亲子鉴定程序后，一方拒绝配合鉴定，通常情况下，法院会倾向于推定存在亲子关系，但确实存在不推定的案例，这主要取决于具体案情和法院的裁量。以下从多个角度对此问题进行分析：

一、法律原则与推定规则

在亲子关系确认诉讼中，亲子鉴定是确定亲子关系的重要手段。根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条：“对亲子关系有异议且有正当理由的，父或者母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。对亲子关系有异议且有正当理由的，成年子女可以向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系。” 当一方提出亲子关系确认之诉，并申请亲子鉴定时，若另一方无正当理由拒绝配合，法院通常会根据证据规则和日常生活经验，推定存在亲子关系。这是因为拒绝配合鉴定的一方未能提供相反证据来反驳对方的请求，应承担举证不能的不利后果。

二、不推定的案例及条件

尽管推定存在亲子关系是常规做法，但也存在不推定的案例。这些案例通常具备以下条件：

1. 拒绝配合方有合理理由：

   • 如果拒绝配合鉴定的一方能够提供充分、合理的理由，如健康原因、心理原因等，且这些理由得到了法院的认可，那么法院可能不会直接推定存在亲子关系。
   • 例如，在某些案例中，被告可能因心理创伤或隐私考虑而拒绝进行亲子鉴定，若法院认为这些理由合理且充分，可能会选择不推定亲子关系，而是寻求其他证据来确认或否认亲子关系。

2. 其他证据足以证明或否认亲子关系：

   • 如果除了亲子鉴定外，还有其他证据能够足以证明或否认亲子关系，如出生证明、血型证据、证人证言等，且这些证据得到了法院的采信，那么法院可能不会依赖亲子鉴定结果，而是根据这些证据来作出判决。
   • 在这种情况下，即使一方拒绝配合亲子鉴定，法院也可能根据其他证据来确认或否认亲子关系，而不会直接推定。

3. 法院对推定规则的审慎适用：

   • 法院在适用推定规则时，会综合考虑案件的具体情况、双方当事人的利益平衡以及社会公共利益等因素。
   • 如果法院认为直接推定存在亲子关系可能对拒绝配合方造成不公平的结果，或者可能引发其他社会问题，那么法院可能会选择不推定，而是寻求更公正、合理的解决方案。

三、法律建议与风险提示

1. 对于提起亲子关系确认之诉的一方：

   • 在提起诉讼前，应尽可能收集其他证据来支持自己的请求，如出生证明、血型证据、证人证言等。
   • 如果对方拒绝配合亲子鉴定，应积极向法院说明情况，并提供合理理由来支持自己的推定请求。
   • 同时，也要做好心理准备，接受法院可能不推定存在亲子关系的结果，并寻求其他法律途径来维护自己的权益。

2. 对于拒绝配合亲子鉴定的一方：

   • 如果确实有合理理由拒绝配合鉴定，应及时向法院说明情况，并提供相关证据来支持自己的理由。
   • 如果担心鉴定结果对自己不利，可以考虑与对方协商解决争议，或者寻求其他法律途径来维护自己的权益。
   • 同时，也要认识到拒绝配合鉴定可能带来的法律后果，如被法院推定存在亲子关系等。

举例说明：

假设在一个亲子关系确认诉讼中，原告（父或母）提起诉讼要求确认与被告（子女）之间的亲子关系，并申请进行亲子鉴定。被告拒绝配合鉴定，理由是担心鉴定结果会对其心理造成创伤。在此情况下，如果被告能够提供心理医生的证明或其他相关证据来支持其理由，且法院认为这些理由合理且充分，那么法院可能不会直接推定存在亲子关系。相反，法院可能会寻求其他证据来确认或否认亲子关系，或者根据案件的具体情况作出其他公正、合理的判决。

总结来说，在确认亲子关系之诉中，若法院启动亲子鉴定程序后一方拒绝配合鉴定，法院是否推定存在亲子关系取决于具体案情和法院的裁量。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。