结论：分公司注销了但总公司还在，若不认可之前的工亡认定，在符合法定条件的情况下，仍然可以申请行政复议。
分析说明：
行政复议的申请资格：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，有权向行政复议机关提出行政复议申请。在此情况下，若总公司认为工亡认定侵犯了其合法权益，即有权提出行政复议申请。
分公司注销的影响：
- 分公司注销并不意味着其法律责任的完全消失。在分公司注销前，其作为总公司的分支机构，所从事的法律行为（包括工亡认定相关事宜）的法律后果通常由总公司承担。因此，即使分公司已经注销，总公司仍然有权对之前的工亡认定提出异议，并通过行政复议等法律途径进行维权。
行政复议的时效性：
- 需要注意的是，行政复议的申请有一定的时效限制。根据《中华人民共和国行政复议法》的规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请；但是法律规定的申请期限超过六十日的除外。因此，总公司需要在法定的时效期限内提出行政复议申请。
行政复议的流程：
- 提出行政复议申请时，总公司需要准备相关的证据材料，如工亡认定的相关文件、分公司注销的证明文件等，以证明其申请行政复议的合法性和合理性。
- 行政复议机关在收到申请后，会进行审查，并根据审查结果作出行政复议决定。如果总公司对行政复议决定不服，还可以依法向人民法院提起行政诉讼。
行动建议：
- 及时准备材料：总公司应尽快收集并整理与工亡认定相关的所有文件和证据，以及分公司注销的证明文件，为申请行政复议做好准备。
- 注意时效限制：务必在法定的时效期限内提出行政复议申请，以免错过维权时机。
- 寻求专业帮助：如果总公司对行政复议的流程或相关法律问题存在疑问，可以寻求专业律师的帮助，以确保申请的顺利进行和维权效果的最大化。
后续思考：
- 在提出行政复议申请后，总公司应密切关注行政复议机关的审查进展和决定结果，以便及时采取进一步的法律行动。
- 如果行政复议决定未能满足总公司的诉求，总公司还可以考虑通过行政诉讼等法律途径继续维权。在此过程中，同样需要准备充分的证据材料和法律依据，以支持其诉讼请求。
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