结论：员工在交通事故中放弃对肇事方的索赔，并不影响其向雇主索赔的权利，但具体能否获得赔偿以及赔偿的数额，需根据工伤认定结果、事故责任划分以及相关法律法规来确定。

分析说明：

1. 工伤认定是前提：

   • 员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害的，应当认定为工伤。这是员工向雇主索赔的基础。
   • 如果员工放弃对肇事方的索赔，但这并不影响其根据工伤保险条例向雇主或工伤保险机构申请工伤认定和赔偿。

2. 雇主责任与工伤保险：

   • 根据《工伤保险条例》，雇主应当为员工参加工伤保险，员工发生工伤时，由工伤保险基金支付相应的工伤待遇。
   • 如果雇主未参加工伤保险，那么员工发生工伤时，雇主需要按照工伤保险条例规定的项目和标准支付费用。

3. 放弃索赔对雇主责任的影响：

   • 员工放弃对肇事方的索赔，是其对自身民事权利的处分，但这并不免除雇主根据工伤保险条例应承担的责任。
   • 雇主不能因为员工放弃对肇事方的索赔而拒绝支付工伤待遇或降低支付标准。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果员工在交通事故中负主要责任或全部责任，那么可能不被认定为工伤，此时员工无法向雇主索赔工伤待遇。
   • 如果员工已经从肇事方获得了赔偿，那么根据相关规定，工伤保险基金或雇主在支付工伤待遇时可能会相应扣减员工已经获得的赔偿部分。但这一规定并不适用于员工主动放弃索赔的情况。

法律建议：

• 及时申请工伤认定：员工在发生交通事故后，应及时向雇主报告，并按照规定申请工伤认定。
• 保留相关证据：员工应保留与交通事故相关的所有证据，包括事故认定书、医疗证明等，以便在申请工伤认定和索赔时使用。
• 咨询专业律师：如果员工在工伤认定和索赔过程中遇到任何问题或疑问，应及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果员工被认定为工伤，且雇主未参加工伤保险，那么雇主需要承担支付工伤待遇的全部责任。
• 如果员工放弃对肇事方的索赔后，又未能被认定为工伤，那么员工可能无法获得任何赔偿。因此，在放弃索赔前，员工应充分了解自己的权益和可能面临的后果。