结论：停薪留职期间，个人部分和公司部分的社保费用全部由个人承担，这一做法是否违法，需分情况讨论，不能一概而论。
分析：
停薪留职的协议内容：
- 停薪留职通常涉及双方（员工和公司）的协议。协议中应明确双方的权利和义务，包括社保费用的承担方式。
- 如果协议中明确规定，在停薪留职期间，社保费用（包括个人部分和公司部分）全部由个人承担，且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法在协议层面是合法的。
法律法规的强制性规定：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位和职工应当共同缴纳社会保险费。这通常意味着，在正常情况下，公司部分的社会保险费应由公司承担。
- 然而，在停薪留职的特殊情况下，如果双方通过协议改变了这一常规做法，且该协议不违反法律法规的强制性规定（如不损害员工的合法权益、不违反社会公共利益等），那么这种改变可能是被允许的。
可能的法律后果：
- 如果停薪留职协议中的社保费用承担方式违反了法律法规的强制性规定，或者损害了员工的合法权益，那么该协议可能被视为无效或部分无效。
- 在这种情况下，员工有权要求公司按照法律法规的规定承担其应承担的社会保险费部分。
建议：
- 对于员工：在签订停薪留职协议前，务必仔细阅读协议内容，特别是关于社保费用承担的部分。如果对此有疑问或不满，应及时与公司沟通并寻求法律意见。
- 对于公司：在制定停薪留职协议时，应确保协议内容符合法律法规的强制性规定，并充分考虑员工的合法权益。避免通过协议将本应由公司承担的社会保险费转嫁给员工，以免引发法律纠纷。
特殊情况说明：
- 如果停薪留职是由于公司原因（如经营困难、裁员等）导致的，且公司要求员工承担全部社保费用作为继续留职的条件，这种做法可能涉嫌违反法律法规的强制性规定，员工有权拒绝并寻求法律援助。
总结：停薪留职期间社保费用的承担方式需根据双方协议和法律法规的强制性规定来判断。如果协议内容合法且不违反员工合法权益，那么个人承担全部社保费用可能是被允许的；否则，这种做法可能是违法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。