结论：设备预付款开全额发票是否合法需分情况讨论，主要取决于交易双方约定、合同履行进度及税务合规性。以下从法律和实务角度展开分析：

1. 若合同明确约定“预付款即开全额发票”，且符合税务规定，则合法

• 合同自由原则：根据《民法典》第465条，合同双方可约定预付款阶段开具全额发票，只要不违反法律强制性规定（如虚开发票、偷逃税等），该约定有效。
• 税务合规性：需满足以下条件：
  • 交易真实发生（设备已交付或部分交付）；
  • 发票内容与实际业务一致（如设备名称、型号、数量等）；
  • 符合增值税纳税义务发生时间规定（如预收款方式销售货物，纳税义务通常为货物发出当天，但合同可约定提前开票）。
• 实务风险：若设备未交付，买方可能以“未收到货物”为由拒付尾款，或要求退还发票，引发纠纷。

2. 若合同未约定或约定不明，提前开全额发票可能存在法律风险

• 税务风险：根据《发票管理办法》第21条，开具发票需与实际经营业务情况相符。若设备未交付，提前开票可能被认定为“虚开发票”（如无真实交易背景），面临税务处罚（如罚款、滞纳金）。
• 民事风险：若买方后续拒收货物或违约，卖方已开具全额发票，可能难以主张未履行部分的价款，需通过诉讼追偿，增加维权成本。

3. 实务建议：如何合法操作？

• 合同条款明确：在合同中约定开票条件（如“预付款到账后X日内开具发票，发票金额为预付款部分”或“设备交付后开具全额发票”），避免歧义。
• 分阶段开票：根据合同履行进度分阶段开票（如预付款开部分发票，验收后开尾款发票），降低税务和民事风险。
• 留存证据：保存设备交付、验收、付款等凭证，证明交易真实性，避免被认定为虚开发票。

总结：设备预付款开全额发票的合法性取决于合同约定和实际履行情况。若双方明确约定且交易真实，可操作；若无约定或设备未交付，建议谨慎处理，避免税务和民事风险。如有具体合同或交易细节，可进一步向我咨询，我会结合条款和实务经验为您分析。