水库项目涉嫌分包转包，一般由县级以上地方人民政府的水行政主管部门或者流域管理机构进行处罚。以下是对此问题的详细分析：

法律依据与处罚主体

1. 《中华人民共和国水法》：该法规定了水资源的保护、开发、利用和管理等方面的内容。对于水库项目等水利工程，若存在违法分包转包行为，水行政主管部门有权依据该法进行处罚。
2. 《中华人民共和国招标投标法》：该法规范了招标投标活动，保护了国家利益、社会公共利益和招标投标活动当事人的合法权益。若水库项目的分包转包行为违反了招标投标法的相关规定，如未经招标擅自分包转包，那么相关的行政监督部门（可能包括水行政主管部门，具体取决于项目性质和招标方式）也有权进行处罚。不过，在大多数情况下，对于水利工程，水行政主管部门是主要的处罚主体。
3. 《中华人民共和国合同法》（现《中华人民共和国民法典》合同编）：虽然该法主要规范合同行为，但若分包转包合同存在违法情形，如违反法律、行政法规的强制性规定，那么合同可能被认定为无效。不过，这更多是民事法律后果，而行政处罚则主要由行政主管部门进行。在涉及水库项目等水利工程的分包转包违法案件中，水行政主管部门会依据相关行政法规进行处罚。

处罚措施

对于违法分包转包行为，水行政主管部门或流域管理机构可能采取的处罚措施包括：

1. 责令改正：要求违法分包转包方立即停止违法行为，并采取措施纠正。
2. 没收违法所得：对违法分包转包方因违法行为所获得的收益进行没收。
3. 罚款：根据违法行为的严重程度和造成的后果，对违法分包转包方处以一定数额的罚款。
4. 吊销资质证书：对于情节严重的违法行为，水行政主管部门或流域管理机构可能吊销违法分包转包方的相关资质证书，禁止其从事水利工程相关活动。

实际操作中的考虑因素

1. 项目性质与规模：不同性质和规模的水库项目，其分包转包行为的监管和处罚可能有所不同。大型水库项目通常受到更严格的监管。
2. 违法行为的具体情形：违法分包转包的具体情形，如是否经过招标、是否涉及工程质量问题等，都会影响处罚的力度和方式。
3. 地方性法规与规章：除了国家层面的法律法规外，地方性法规和规章也可能对水库项目的分包转包行为进行规范，并规定相应的处罚措施。

建议：若您涉及水库项目的分包转包问题，建议首先了解并遵守相关法律法规和招标文件的规定。若存在违法行为或面临处罚风险，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详尽的法律建议。