结论前置：关于与公司约定的底薪是以劳动合同为准还是以实际执行的为准，一般情况下应以劳动合同中约定的底薪为准，但在特定情况下，如实际执行的底薪与劳动合同约定不一致且双方无异议，或存在其他合法情形时，可能以实际执行的为准。这一结论主要依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
详细分析：
以劳动合同约定为准：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第十七条，劳动合同应当具备劳动报酬等条款。这意味着，劳动合同中关于底薪的约定是双方协商一致的结果，具有法律约束力。
- 实践应用：在正常情况下，用人单位和劳动者都应按照劳动合同中约定的底薪来履行各自的义务。如果用人单位擅自降低底薪，劳动者有权依据劳动合同要求用人单位支付足额的工资。
以实际执行为准的特殊情况：
- 双方无异议：如果在实际工作中，用人单位和劳动者都默认按照实际执行的底薪来履行，且双方对此均无异议，那么在实际操作中，可能会以实际执行的底薪为准。但这种情况需要双方有明确的共识，且不违反法律法规的强制性规定。
- 合法变更：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。如果双方就底薪的变更达成了书面协议，并且该协议不违反法律法规的强制性规定，那么变更后的底薪将具有法律效力。
- 存在欺诈、胁迫等情形：如果劳动合同中关于底薪的约定是在欺诈、胁迫等情形下签订的，那么该约定可能被视为无效。在这种情况下，实际执行的底薪（如果合法且双方认可）可能成为确定劳动报酬的依据。但这种情况较为特殊，需要劳动者提供充分的证据来证明。
法律建议：
- 劳动者：在签订劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于劳动报酬的部分。如果发现合同中的底薪与实际执行的不一致，应及时与用人单位沟通并要求书面确认。如果用人单位擅自降低底薪，劳动者可以依据劳动合同和相关法律法规要求用人单位支付足额的工资，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 用人单位：应严格遵守劳动合同的约定，不得擅自变更劳动报酬等关键条款。如果需要变更底薪等劳动报酬，应与劳动者协商一致并签订书面协议。同时，用人单位应确保劳动合同的签订过程合法合规，避免出现欺诈、胁迫等情形。
可能后果：
- 如果用人单位擅自降低底薪且未与劳动者协商一致，劳动者有权要求用人单位支付足额的工资差额，并可能因此解除劳动合同并要求用人单位支付经济补偿。
- 如果劳动者和用人单位就底薪的变更达成了书面协议且该协议合法有效，那么双方应按照变更后的底薪来履行各自的义务。如果一方违反协议约定，另一方有权要求其承担相应的法律责任。
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