确认行政行为违法但不撤销，通常意味着行政机关在行政诉讼中败诉。以下是对这一问题的详细分析：
一、确认违法判决的适用情形
在行政诉讼中，当行政行为存在特定情形时，人民法院不会选择撤销或判决履行，而是会判决确认该行政行为违法。这些情形主要包括：
行政行为违法，但不具有可撤销内容：
- 某些行政行为虽然违法，但由于其已经实施完毕或其性质决定了无法通过撤销来恢复原状。例如，行政机关工作人员在执法过程中对相对人进行了辱骂、殴打等不当行为，该行为已造成一定影响，但无法撤销以消除影响；或者在违法建筑或征收案件中，如房子已被拆除，法院无法撤销强制拆除行为，只能确认该行为违法。
被告改变原违法行政行为，原告仍要求确认原行政行为违法：
- 诉讼过程中，若被告认识到原行政行为的违法性并主动纠正，但原告因对原行为不满或其他原因仍要求确认其违法，法院可根据具体情况判决确认原行政行为违法。例如，行政机关对某企业作出了错误的行政处罚决定，后在诉讼中自行撤销了该决定。然而，企业认为原处罚严重损害了其声誉，坚持要求法院确认原处罚行为违法。此时，法院将依法作出确认违法的判决。
被告不履行或者拖延履行法定职责，判决履行没有意义：
- 当被告存在不履行或拖延履行法定职责的情况，且即使判决履行也无法达到预期效果或没有实际意义时，法院将判决确认其行为违法。例如，某行政机关未在法定期限内对某公民的行政许可申请作出决定。待公民提起诉讼时，由于政策调整或客观情况变化，该许可事项已不再具有实际意义。此时，法院判决行政机关履行审批职责已无实际意义，将确认其不履行法定职责的行为违法。
二、确认违法判决的法律后果
行政机关败诉：
- 确认违法判决是对违法行政行为的否定性评价，意味着行政机关在行政诉讼中败诉。这将对行政机关的声誉和公信力产生负面影响，并可能引发行政机关内部的问责机制。
原告有权主张赔偿：
- 行政行为被确认违法后，如果给原告造成了损失，原告有权依法向行政机关主张赔偿。这是保护公民合法权益、监督行政机关依法行政的重要制度保障。
三、注意事项
确认违法判决的严格适用：
- 确认违法判决是对违法行政行为的“宽容”和妥协，必须严格适用，不能任意解释。法院在作出确认违法判决时，应充分考虑行政行为的性质、情节以及社会影响等因素。
行政机关的自我纠正：
- 行政机关在认识到行政行为违法后，应主动纠正错误，以减少对公民合法权益的损害。同时，行政机关也应加强内部监督和管理，提高依法行政水平，避免类似违法行为的再次发生。
总结与建议：确认行政行为违法但不撤销，通常意味着行政机关在行政诉讼中败诉。这将对行政机关产生负面影响，并可能引发赔偿等法律后果。因此，行政机关应加强依法行政意识，提高行政行为的合法性和合理性，以维护公民合法权益和社会公共利益。如果您在行政诉讼中遇到类似问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。