房屋所有权过户给儿子时，有约定协议通常是有效的，但具体有效性需根据协议内容、签订方式及是否违反法律法规的强制性规定等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的基本条件
协议内容合法：
- 协议内容必须符合法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗。例如，协议中不能约定通过非法手段获取房屋所有权，或者约定违反税收法规等。
签订方式合法：
- 协议应当采用书面形式，并由双方当事人签字或盖章确认。如果涉及房屋过户，通常还需要办理相关的过户手续，如缴纳税费、办理产权变更登记等。
双方当事人具有完全民事行为能力：
- 签订协议的双方当事人必须具备完全民事行为能力，能够理解和承担协议中的权利和义务。如果一方或双方为限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则协议可能无效或需要法定代理人的同意。
二、协议可能无效的情形
协议内容违法或违反公序良俗：
- 如前所述，如果协议内容违反法律法规的强制性规定或公序良俗，则协议无效。例如，约定通过欺诈、胁迫等手段获取房屋所有权，或者约定将房屋所有权转让给非法组织等。
协议签订时存在欺诈、胁迫等情形：
- 如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方在违背真实意思的情况下签订协议，则受欺诈、胁迫方有权请求人民法院或仲裁机构撤销协议。
协议未办理相关过户手续：
- 虽然协议本身可能有效，但如果未按照法律法规的规定办理房屋过户手续，如未缴纳税费、未办理产权变更登记等，则房屋所有权可能并未实际转移给儿子。在这种情况下，协议虽然有效，但可能无法实现其预期的法律效果。
三、法律建议
确保协议内容合法合规：
- 在签订协议前，务必确保协议内容符合法律法规的强制性规定和公序良俗。如有必要，可以咨询专业律师或法律机构进行审查。
采用书面形式并签字盖章：
- 协议应当采用书面形式，并由双方当事人签字或盖章确认。这样可以确保协议的真实性和有效性，并在发生纠纷时提供有力的证据。
及时办理过户手续：
- 在签订协议后，应及时按照法律法规的规定办理房屋过户手续，如缴纳税费、办理产权变更登记等。这样可以确保房屋所有权实际转移给儿子，并避免后续的法律纠纷。
考虑协议的具体条款和细节：
- 在签订协议时，应充分考虑协议的具体条款和细节，如房屋的具体信息、过户的时间节点、违约责任等。这些条款和细节将直接影响协议的有效性和可执行性。
举例说明：假设您与儿子签订了一份房屋过户协议，约定将您名下的一套房屋过户给儿子。在签订协议前，您确保协议内容合法合规，并采用了书面形式由双方签字确认。随后，您按照法律法规的规定办理了房屋过户手续，如缴纳了相关税费并办理了产权变更登记。在这种情况下，该协议是有效的，且房屋所有权已经实际转移给了儿子。
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