结论：企业一般不能直接起诉员工拿走身份证和毕业证的行为，但可能通过其他途径维护自身权益或要求员工承担相应责任。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律性质分析：

   • 身份证和毕业证属于员工的个人证件，员工对其享有所有权。离职时，员工有权取回自己的个人证件，这是基于个人财产权的合理行为。
   • 然而，如果员工在离职过程中未经公司同意，擅自拿走公司保管的身份证和毕业证复印件（若公司有保管责任且员工未归还），或者拿走证件的行为影响了公司的正常运营或造成了其他损失，那么公司的权益可能受到侵害。但即便如此，公司直接起诉员工“拿走”行为本身，在法律上可能并不直接构成起诉的充分理由，除非该行为同时构成了其他违法行为，如盗窃、侵占等。

2. 公司可能的维权途径：

   • 要求归还：如果员工拿走的是公司保管的证件复印件或原件（且公司有合法保管理由），公司可以要求员工归还。若员工拒绝，公司可以通过内部沟通、发送律师函等方式进一步要求。
   • 追究违约责任：如果员工与公司之间有劳动合同或相关协议，且协议中明确规定了员工在离职时应遵守的程序和规定，包括证件的归还等，那么员工违反这些规定可能构成违约。公司可以依据合同或协议追究员工的违约责任。
   • 报警处理：如果员工拿走证件的行为涉嫌盗窃、侵占等违法行为，公司可以向公安机关报案，由公安机关依法处理。

3. 员工应注意的法律风险：

   • 员工在离职时，应遵守公司的规章制度和劳动合同或协议中的相关规定，妥善处理个人证件的归还事宜。
   • 如果员工确实需要拿走自己的证件，应与公司进行沟通并取得同意，以避免不必要的法律纠纷。
   • 如果员工拿走证件的行为给公司造成了损失，员工可能需要承担相应的赔偿责任。

4. 实际操作建议：

   • 对于公司而言，建议完善离职流程，明确员工在离职时应归还的证件和物品清单，并要求员工签字确认。
   • 对于员工而言，建议在离职前与公司沟通好个人证件的归还事宜，确保离职过程顺利且避免法律纠纷。

法律依据：虽然直接针对此问题的具体法律条款可能并不明确，但相关法律原则如《中华人民共和国民法典》中关于财产权、合同违约责任等规定，以及《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》中关于劳动合同和离职程序的规定，都可以为公司和员工在处理此类问题时提供法律指导和依据。

总结与建议：企业一般不能直接起诉员工拿走身份证和毕业证的行为本身，但可以通过要求归还、追究违约责任或报警处理等方式维护自身权益。员工在离职时应遵守相关规定，妥善处理个人证件的归还事宜，以避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。