员工在公司上班时，帮助公司抵税的行为是否合法，这取决于具体的操作方式和抵税的性质。以下从几个角度进行详细分析：

1. 合法抵税行为：

   • 如果员工提供的发票或信息是真实、合法且与公司实际业务相关的，用于正常的税务抵扣，这是完全合法的。例如，员工因公出差产生的交通、住宿费用，取得合法发票后由公司报销并用于税务抵扣，这是符合税法规定的。

2. 非法抵税行为：

   • 虚开发票：如果员工为了帮助公司抵税而虚开发票，即开具与实际交易不符的发票，或者在没有真实交易的情况下开具发票，这是严重的违法行为。根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关法律法规，虚开发票将面临罚款、没收违法所得，甚至可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
   • 利用个人账户进行税务规避：有些员工可能通过个人账户接收公司款项，再以个人名义开具发票给公司，以此帮助公司规避税务。这种行为同样违法，因为它涉及到了偷逃税款，违反了税收征管的相关法律法规。
   • 其他非法手段：如利用政策漏洞、伪造合同或单据等手段进行税务抵扣，也是不合法的。

3. 法律后果：

   • 对于员工而言，参与非法抵税行为可能面临法律责任，包括但不限于罚款、没收违法所得、刑事处罚等。同时，这种行为也会损害员工的职业声誉，对未来的职业发展造成不利影响。
   • 对于公司而言，非法抵税行为将面临税务机关的严厉处罚，包括补缴税款、滞纳金、罚款等。在严重情况下，公司还可能被吊销营业执照，甚至相关责任人可能面临刑事责任。

4. 建议：

   • 员工应严格遵守法律法规，不要参与任何形式的非法抵税行为。如果公司要求员工进行非法操作，员工应坚决拒绝，并及时向相关部门举报。
   • 公司应建立健全的财务管理制度，确保所有税务抵扣行为都合法合规。同时，公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识，避免因为无知而触犯法律。

总结来说，员工在公司上班时，帮助公司进行合法、真实的税务抵扣是可以的，但绝不能参与任何形式的非法抵税行为。如果有任何疑问或不确定的地方，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。