关于公司使用员工发票抵税的合法性，这是一个涉及多方面法规的复杂问题。下面我将从合法与不合法两种情况，为您详细分析。

合法情况

1. 真实业务关联： 如果员工提供的发票是基于公司真实的业务活动，比如公务出差的差旅费（包括机票、火车票、住宿费等）、业务招待的餐饮费，或是为公司采购的办公用品等，并且这些费用都符合公司的报销规定以及税法要求，那么公司是可以将这些发票作为合法有效的凭证，进行账务处理和税务抵扣的。这种情况下，公司使用员工发票抵税是合法的，因为发票反映了真实的交易活动，且与公司业务直接相关。

2. 合规操作： 公司必须确保整个报销流程都是合规的，包括审核发票的真实性、合理性，以及确认其与公司业务的关联性。同时，公司还应严格遵守税法规定，正确计算应纳税所得额，并按时申报纳税。

不合法情况

1. 虚开发票： 如果员工提供的发票是通过非法手段取得的，比如购买假发票，或者在没有真实交易的情况下开具发票（即虚开发票），那么公司使用这类发票抵税就是违法的。根据《中华人民共和国发票管理办法》，虚开发票属于严重的税务违法行为，公司将面临补缴税款、罚款、滞纳金等处罚，甚至可能追究刑事责任。

2. 与业务无关的个人消费： 如果员工提供的发票是个人消费产生的，比如个人购物、餐饮、娱乐等，与公司业务无关，那么公司不能使用这些发票进行税务抵扣。税法明确规定，只有与企业取得收入相关的、合理的支出才可以在计算应纳税所得额时扣除。

3. 侵犯劳动者权益： 如果公司要求员工提供发票抵税，实际上是在变相克扣员工工资或福利，这是违反《中华人民共和国劳动法》的行为。公司应尊重员工的合法权益，不得无故克扣员工工资或要求员工承担本应由公司承担的税费。

总结与建议

综上所述，公司使用员工发票抵税的合法性取决于多个因素，包括发票的真实性、与公司业务的关联性以及是否符合相关法规要求。为避免法律风险，我建议您公司采取以下措施：

• 建立完善的报销制度和流程，确保发票的真实性和合理性。
• 对员工进行税法培训，提高员工的税收法律意识。
• 咨询专业税务机构或律师，确保税务处理的合规性。
• 遵守劳动法规定，保障员工的合法权益。

总之，公司在使用员工发票进行税务抵扣时，应谨慎行事，确保操作的合法性和合规性。