让员工用发票抵工资是违法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 明确结论：

   • 企业应以法定货币形式及时足额支付劳动者工资，不得以发票抵工资。

2. 法律依据与分析：

   • 劳动法角度：根据《劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第五条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠，也不得以实物及有价证券替代货币支付。用发票抵工资直接违反了这一规定。
   • 税收征管角度：依据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，若企业通过伪造、变造、隐匿账簿等手段不缴或少缴税款，属于偷税行为。让员工用发票抵工资，可能涉及虚开发票以虚报成本，从而减少企业所得税应纳税额，构成偷税漏税，将面临税务机关的追缴、滞纳金及罚款，甚至刑事责任。
   • 会计核算角度：根据《中华人民共和国会计法》，企业的会计核算应真实、准确反映经济业务和财务状况。用发票抵工资会导致会计账目混乱，无法真实反映企业成本费用，影响财务报表的真实性和可靠性。
   • 员工权益保障角度：此做法增加了员工寻找发票的负担和风险，可能导致员工购买不必要的商品或服务，甚至面临法律后果。同时，报销款不计入工资还可能影响经济补偿金的计算，从而损害员工的切身利益。

3. 实际情况与风险：

   • 报销款与工资有本质区别。报销款是企业对员工因工作发生的相关费用的补偿，如差旅费、伙食费等，数额不固定且根据实际发生情况实报实销。若用人单位将报销款项作为规避税收监管的手段，或未明确约定报销款项性质，则可能构成违法行为。
   • 若劳动合同中明确约定了薪资包含报销款项，并明确了报销的具体条件和范围，则应按约定执行。但若无明确约定，报销款一般不视为工资。若双方约定了固定金额的报销款作为补贴发放，且可凭任意发票领取，这实际上构成了以发票抵工资的行为，是违法的。

4. 法律后果：

   • 对于企业而言，除了可能面临税务部门的处罚外，还可能因违反劳动法规定而被责令改正、支付赔偿金等。
   • 对于员工而言，若配合企业用发票抵工资并导致个人所得税未如实申报缴纳，也可能面临税务部门的处罚。

综上所述，让企业用发票抵工资是明确的违法行为，既违反了法律法规，又损害了劳动者的合法权益和企业的财务管理。因此，企业应严格遵守相关法律法规，以法定货币形式及时足额支付劳动者工资，确保财务管理的合规性与透明度。同时，劳动者也应提高法律意识，维护自己的合法权益不受侵害。若您或您所在的企业面临此类问题，请及时向我咨询，我将为您提供专业的法律建议。