将层高4.5米的商铺装修时分隔成两层，是否合法需分情况讨论，具体如下：
若商铺产权性质允许且符合规划要求
- 产权性质：首先需确认商铺的产权性质，即该商铺是否属于商业用途，且产权证上是否明确标注了层高及使用方式。若产权证上未对层高使用有特别限制，且商铺本身设计用于商业活动，那么从产权角度，进行内部装修分隔通常是可行的。
- 规划要求：其次，需查阅当地的城市规划、建筑规范及消防安全规定。不同地区对于商业建筑的内部装修、层高利用及消防安全有具体要求。例如，某些地区可能要求商业空间在分隔后仍需保持一定的通风、采光或消防通道标准。若装修方案符合这些规划要求，那么分隔成两层是合法的。
若商铺产权性质或规划要求存在限制
- 产权限制：若商铺产权证上明确标注了禁止或限制对层高进行分隔使用的条款，那么进行此类装修将违反产权约定，可能面临产权纠纷或法律责任。
- 规划违规：即使产权上无限制，但若装修方案违反了当地的城市规划、建筑规范或消防安全规定，如未按规定设置消防通道、通风口等，那么该装修行为也是不合法的。在此情况下，不仅可能面临行政处罚，还可能对商铺的正常使用及安全造成隐患。
法律建议：
- 在进行装修前，务必仔细查阅商铺的产权证及相关规划文件，了解产权性质及规划要求。
- 咨询当地的城市规划部门、建筑管理部门或消防部门，获取关于商铺内部装修的具体规定及审批流程。
- 制定装修方案时，应充分考虑消防安全、通风采光等因素，确保装修后的商铺符合相关法规要求。
- 若对装修方案的合法性存在疑问，建议咨询专业律师或相关机构，以避免潜在的法律风险。
可能后果：
- 若未经审批擅自进行装修分隔，可能面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
- 若装修行为违反了消防安全规定，还可能对商铺内的人员及财产安全造成威胁，一旦发生火灾等事故，将承担严重的法律责任。
综上所述，将层高4.5米的商铺装修时分隔成两层是否合法，需根据商铺的产权性质、规划要求及装修方案的具体情况来判断。在进行装修前，务必进行充分的调查与咨询，以确保装修行为的合法性与安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。