结论：商品房单层建筑高度4.5米以上，装修成两层是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及是否改变房屋结构、是否符合建筑安全标准、是否获得相关审批以及是否违反物业管理规定等多个方面。以下从这几个角度进行详细分析：

1. 是否改变房屋结构：

   • 如果装修过程中仅对房屋内部空间进行合理划分，未对房屋的主体结构（如承重墙、梁、柱等）进行改动，那么这种装修行为通常是合法的。
   • 若装修过程中涉及对房屋主体结构的改动，如拆除承重墙、改变梁柱位置等，则可能违反《建筑法》和《住宅室内装饰装修管理办法》等相关规定，属于违法行为。

2. 是否符合建筑安全标准：

   • 装修成两层后，需确保新增加的楼层（如阁楼、夹层等）符合建筑安全标准，包括但不限于结构安全、消防安全、电气安全等。
   • 若新增加的楼层存在安全隐患，如结构不稳固、消防通道不畅、电气线路混乱等，则可能违反相关安全规定，面临被责令整改或处罚的风险。

3. 是否获得相关审批：

   • 在进行装修前，需向相关部门（如物业、城建部门等）申请装修许可，并提交装修方案。若装修方案涉及改变房屋结构或增加楼层，则需获得相关部门的审批同意。
   • 若未经审批擅自进行装修，可能面临被责令停止施工、恢复原状或罚款等处罚。

4. 是否违反物业管理规定：

   • 不同小区的物业管理规定可能有所不同，部分小区可能对装修行为有特别限制，如禁止改变房屋外观、禁止增加楼层等。
   • 若装修行为违反了物业管理规定，可能面临物业的制止、罚款或采取其他管理措施。

建议：

• 在进行装修前，建议先咨询物业或相关部门，了解装修规定和审批流程。
• 确保装修方案符合建筑安全标准，避免存在安全隐患。
• 若涉及改变房屋结构或增加楼层，务必获得相关部门的审批同意后再进行施工。

可能后果：

• 若未经审批擅自进行装修或违反相关规定，可能面临被责令停止施工、恢复原状、罚款等处罚。
• 若因装修导致房屋结构受损或存在安全隐患，可能需承担相应的法律责任和赔偿责任。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。