结论：要认定儿子的车挂在父亲的物流公司这种挂靠关系无效，通常需要基于挂靠行为违反了法律法规的强制性规定、损害了社会公共利益或存在欺诈、胁迫等情形。以下从不同角度详细分析：
一、挂靠关系的基本法律特征
挂靠关系通常指的是一方（挂靠人）以另一方（被挂靠人）的名义从事经营活动，并向被挂靠人支付一定费用的行为。在公司法务领域，这种关系可能涉及车辆挂靠、资质挂靠等多种形式。挂靠关系本身并不必然无效，但其有效性取决于是否违反了法律法规的强制性规定或损害了社会公共利益。
二、认定挂靠关系无效的情形
违反法律法规的强制性规定：
- 如果挂靠行为违反了《道路交通安全法》、《道路运输条例》等相关法律法规的强制性规定，如未经许可擅自从事道路运输经营，那么这种挂靠关系可能被认定为无效。
- 例如，如果儿子的车并未取得道路运输经营许可证，却以父亲的物流公司名义从事运输活动，这种挂靠行为就违反了法律法规的强制性规定，可能被认定为无效。
损害社会公共利益：
- 如果挂靠行为损害了社会公共利益，如扰乱了市场秩序、危害了公共安全等，那么这种挂靠关系也可能被认定为无效。
- 例如，如果儿子的车存在安全隐患，却以父亲的物流公司名义从事运输活动，给公共安全带来了威胁，这种挂靠行为就可能因损害社会公共利益而被认定为无效。
存在欺诈、胁迫等情形：
- 如果挂靠关系的建立是基于欺诈、胁迫等不正当手段，那么这种挂靠关系也可能被认定为无效。
- 例如，如果父亲以威胁或欺骗的方式迫使儿子将车辆挂靠在其物流公司名下，这种挂靠行为就可能因存在欺诈、胁迫等情形而被认定为无效。
三、认定挂靠关系无效的法律后果
如果挂靠关系被认定为无效，那么根据《民法典》的相关规定，因该无效行为取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
四、建议与措施
审查挂靠协议：
- 如果存在挂靠协议，应仔细审查协议内容，确认是否存在违反法律法规的强制性规定或损害社会公共利益的条款。
收集证据：
- 如果认为挂靠关系可能无效，应收集相关证据，如车辆行驶证、道路运输经营许可证、挂靠协议、支付费用凭证等，以证明挂靠行为的违法性或损害性。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师，以便更准确地判断挂靠关系的有效性，并采取相应的法律措施。
进一步思考：在实际操作中，认定挂靠关系无效并非易事，需要综合考虑多种因素。因此，在涉及挂靠关系时，应谨慎对待，确保挂靠行为的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。