结论：公司补发工资并不必然导致您不能主张经济补偿，具体能否获得支持，需根据您的仲裁请求、事实依据及法律依据综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、因未及时足额支付工资而主张经济补偿的情况
一般情况：
- 根据《劳动合同法》第三十八条及第四十六条，若公司未及时足额支付劳动报酬，您有权解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。
- 若您在仲裁期间以公司拖欠工资为由主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿，且已按照法定程序向公司发送了被迫解除劳动合同的通知，那么即使公司在仲裁期间补发了工资，您的经济补偿请求仍有可能得到支持。关键在于您是否已履行了法定解除程序，且公司拖欠工资的事实客观存在。
特殊情况：
- 如果公司能够证明其补发工资的行为并非出于恶意拖欠，而是由于财务系统故障、资金临时周转困难等客观原因导致的工资延迟发放，并且在发现问题后及时进行了补发，那么在这种情况下，您主张经济补偿的请求可能不会得到仲裁机构或法院的支持。此时，公司需承担举证责任，证明其非恶意拖欠。
二、基于其他合法理由主张经济补偿的情况
- 如果您申请劳动仲裁并要求经济补偿是基于除拖欠工资以外的其他合法理由，如公司违法解除劳动合同、未依法为您缴纳社会保险费等，那么公司补发工资的行为并不会影响您基于这些理由来主张经济补偿。
- 举例：若公司无故辞退了您，您因此申请仲裁并要求支付违法解除劳动合同的赔偿金，即使公司后来补发了工资，也不能改变其违法解除劳动合同的事实，您依然有权要求相应的经济补偿。
三、证据的重要性
- 在决定是否继续追求经济补偿时，您应充分考虑自己手中是否掌握有足够的证据来支持自己的仲裁请求。
- 证据类型：包括但不限于劳动合同、工资条、银行转账记录、被迫解除劳动合同的通知、公司违法行为的证据（如无故辞退的书面通知、未缴纳社保的证明等）。
- 建议：如果您有确凿的证据证明公司之前确实存在违法行为，那么您可以继续要求经济补偿，并且您的请求很有可能会得到仲裁委的支持。
四、实际操作建议
- 整理证据：首先，整理好所有能证明公司拖欠工资或其他违法行为的证据。
- 明确仲裁请求：根据您的实际情况，明确您的仲裁请求是要求经济补偿还是其他赔偿。
- 咨询专业意见：如果您对仲裁程序或法律条款有疑问，可以向我进一步咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。
最后，公司补发工资并不意味着您不能主张经济补偿，关键在于您的具体仲裁请求、事实依据以及法律依据。如果您认为自己的权益受到了侵害，完全可以勇敢地站出来，通过法律途径来寻求公正和赔偿。有问题可以直接向我咨询，我会尽我所能为您提供帮助。