公司补发工资并不必然导致劳动者不能主张经济补偿，具体是否支持经济补偿需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 因未及时足额支付工资而主张经济补偿的情况

   • 一般原则：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位如未及时足额支付劳动报酬，劳动者有权解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。若公司在仲裁期间补发了工资，但劳动者原本是以用人单位拖欠工资为由主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿的，只要劳动者的主张符合法定条件（如已按照法定程序向用人单位发送了被迫解除劳动合同的通知），其经济补偿的请求仍有可能得到支持。
   • 特殊情况：如果公司能够证明其补发工资的行为并非出于恶意拖欠，而是由于财务系统故障、资金临时周转困难等客观原因导致的工资延迟发放，并且在发现问题后及时进行了补发，那么在这种情况下，劳动者主张经济补偿的请求可能不会得到仲裁机构或法院的支持。

2. 基于其他合法理由主张经济补偿的情况

   • 如果劳动者申请劳动仲裁并要求经济补偿是基于除拖欠工资以外的其他合法理由，如用人单位违法解除劳动合同、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，那么公司补发工资的行为并不会影响劳动者基于这些理由来主张经济补偿。例如，如果公司无故辞退了员工，员工因此申请仲裁并要求支付违法解除劳动合同的赔偿金，即使公司后来补发了工资，也不能改变其违法解除劳动合同的事实，员工依然有权要求相应的经济补偿。

3. 证据的重要性

   • 在决定是否继续追求经济补偿时，劳动者应充分考虑自己手中是否掌握有足够的证据来支持自己的仲裁请求。如果有确凿的证据证明公司之前确实存在违法行为（如无故克扣员工工资、拒不支付加班费、非法解除劳动合同等），那么劳动者可以继续要求经济补偿，并且其请求很有可能会得到仲裁委的支持。

建议：

• 劳动者在申请劳动仲裁前，应尽可能收集并保存好与案件相关的证据，如工资条、劳动合同、解除劳动合同的通知等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
• 如果公司补发了工资，但劳动者认为公司之前的行为已经构成了违法行为，且该违法行为与补发工资无关，那么劳动者仍然有权继续主张经济补偿。
• 在仲裁过程中，劳动者应积极配合仲裁机构的工作，如实陈述事实，提供证据，以便仲裁机构能够全面、客观地了解案件情况，并作出公正的裁决。

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