补发工资后，劳动者是否仍能主张经济补偿金，需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、补发工资时间点对经济补偿金的影响
劳动者提出辞职前补发：
- 若公司在劳动者提出辞职前（非提请劳动仲裁前）已足额补发工资，且无主观恶意，多数地区的司法实践中，违法性可视为已消除。例如，浙江省高级人民法院、山东省高院及广州市中院的相关规定均明确，劳动者提出解除劳动合同前，用人单位已补正未及时足额支付劳动报酬情形的，劳动者主张解除劳动合同经济补偿的，不予支持。
劳动者提出辞职后补发：
- 若劳动者以“未及时足额支付劳动报酬”为由提出辞职，且公司在劳动者辞职后补发工资，公司仍需支付经济补偿。因为《劳动合同法》第46条规定，劳动者依第38条解除劳动合同，用人单位必须支付经济补偿，该义务的触发依据是解除前的违法事实，而非解除后的补救行为。
二、经济补偿金的计算方式
若劳动者有权获得经济补偿，其计算方式如下：
- 工作年限计算：工作每满一年，用人单位需支付一个月工资作为补偿；工作时长在六个月以上但不满一年的，按一年计算补偿；不满六个月的，则支付半个月工资的补偿。
- 月工资标准：月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
三、难以获得经济补偿的情况
- 未因此解除劳动合同：若用人单位及时补发了工资，并且劳动者没有因此解除劳动合同，实践中劳动者想要获得经济补偿可能存在一定难度。
- 缺乏证据支持：若劳动者主张经济补偿，但无法提供充分证据证明用人单位存在未及时足额支付劳动报酬等违法行为，其主张可能不被支持。
四、其他损失赔偿
- 其他损失主张：倘若拖欠工资给劳动者造成了其他方面的损失，如因离职导致的新工作损失等，劳动者可以另行主张赔偿。但需注意，对于新工作损失等间接损失，法院可能因证据不足而不予支持。
五、实务建议
劳动者角度：
- 在提出辞职前，务必确认公司是否已足额补发工资，以避免因补发时间点问题而丧失经济补偿权利。
- 若决定辞职并主张经济补偿，应保留好相关证据，如工资条、银行转账记录、辞职通知书等。
用人单位角度：
- 应尽量避免出现未及时足额支付劳动报酬的情况，若确实存在经营困难，应及时与劳动者协商并达成一致。
- 在收到劳动者的辞职通知书后，若意识到存在违法行为，应及时补正并尝试与劳动者协商解决，以避免支付经济补偿。
举例说明：
- 假设张三在公司工作五年，月工资为10000元。公司因经营困难拖欠张三三个月工资，后在张三提出辞职后补发。此时，张三有权主张经济补偿，计算方式为：5年×1个月工资/年=5个月工资，即50000元。
- 若公司在张三提出辞职前已补发工资，且张三未因此解除劳动合同，则张三可能难以获得经济补偿。
结论：补发工资后，劳动者是否仍能主张经济补偿金，取决于补发工资的时间点、劳动者是否因此解除劳动合同以及能否提供充分证据。如有具体法律问题，可直接向我咨询。